Те, для кого Принципиальное соглашение должно было стать первым шагом к общему совершенно новому состоянию отношений католицизма с израильским обществом и культурой, были разочарованы годами, последовавшими за подписанием Принципиального соглашения, как и те, кто ожидал быстрого разрешения оставшихся вопросов. Участники переговоров верили, что семена, посеянные Принципиальным соглашением, со временим принесут положительные плоды. Что касается Иоанна Павла II, он оказал ощутимое влияние на разработку соглашения. Он принял основополагающие решение – добиваться полных дипломатических отношений с Израилем.
В течение 1997-1998гг., первых лет подготовки к Великому Юбилею- экуменический диалог с Православной и Лютеранской Церквями, на которые возлагались большие надежды, осложнился. Кроме этого разгорелся новый спор после того, как Святой Престол выпустил заявление, касающееся Католической Церкви и Холокоста. Диалог с Православием осложнился осенью 1997 года. Надежды на долгожданную встречу между патриархом Алексием II и Иоанном Павлом II неоправдались, и это ещё больше осложнило диалог Рима с Вселенским Патриархом Константинопольским Варфоломеем I. Напряжение между Русской Православной и возрождающейся Греко-Католической Церковью на Украине, внутренние трения между Алексием II и Варфоломеем II были главными факторами, повлиявшими на возможность встречи папы с Алексием II. В конце 1998 года наметился прогресс, по крайней мере в решении одной проблемы, когда Патриарх Румынской Православной Церкви Феоксист заявил, что будет приветствовать паломничество Иоанна Павла II в Румынии, которое в мае 1999 года стало первым паломничеством папы в страну, большей частью православную.
Призыв Иоанна Павла к Церкви очистить свою совесть на пороге третьего тысячелетия включал и подведение итогов антисемитским христианским предубеждениям и их проявлений на протяжении всех 2000 лет истории христианства. На римском теологическом симпозиуме «Корни антисемитства в христианстве» в октябре 1997 года папа признал, что ошибочная и несправедливая интерпретация Нового Завета, оценивающая евреев и их предполагаемую вину, существовала слишком долго и содействовала усыплению совести среди христиан. Папа отмечал, что прошлое должно быть пересмотрено, ради очищения воспоминаний и подготовки будущего, в котором должно быть всеобще признано, что антисемитизм не имеет права ни малейшего оправдания и осуждается безоговорочно. Комиссия по религиозным отношениям с иудеями работала над созданием документа по Шоаху ещё с 1987 года. Одиннадцать лет спустя документ «Мы помним: размышление о Шоахе» был наконец опубликован. Критики документа сравнивали его с заявлением немецкой Конференции епископов 1995 года, которая признавала «со-ответственность» за трагедию Холокоста, и заявление французских епископов 1997 году, просивших у евреев прощения за ошибки христиан в отношении еврейского народа во время немецкой оккупации.
Впечатляющим моментом Юбилея 2000 года было проводимое в начале Великого Поста «очищение памяти», (названное «Меа сиlpa» – моя вина), что было впервые в истории Церкви. 12 марта Папа выступил с публичной просьбой о прощении к Богу за противоречия любви в служении истины, за деяния против общности Церкви, за обиды какому бы то ни было народу, за применение насилия, за дискриминации, угнетения, притеснение бедных и беззащитных, совершенные христианами в ходе истории.
Через несколько дней Иоанн Павел II нанёс папские визиты в Израиль, в ходе которого молился у стены плача в Иерусалиме и в Афины, где Понтифик просил прощения за разорение Константинополя крестоносцами.
Можно отметить также важные события в последний период понтификата: 6 мая 2001г. Иоанн Павел II стал первым папой, посетившим мечеть (в Дамаске). А в 2004 году папа направил в дар Русской Православной Церкви ценный список иконы Казанской Божией Матери, который хранился в личной капелле понтифика, и перед которой он каждый день молился.
Завершение жизни Иоанна Павла II в октаву Пасхи символично указывает особое призвание этого человека, которого ещё при жизни называли Святым… Умирая, 2 апреля 2005 года, понтифик говорил: «Я полон радости, вы также пребывайте в радости. Давайте с радостью молиться вместе».
Говоря об основных чертах дипломатии Святого престола Иоанн Павел II выделяет её гуманитарное измерение. В гуманитарное измерение дипломатии входит: обеспечение интересов местных церквей, искоренение насилия в международной жизни, укрепление веры в человека, деятельность в пользу усовершенствования человеческой личности, путём пробуждения в ней чувства истины, справедливости, братства, или, по крайней мере, осторожности.
В то же время в Ватикане подчёркивают что этическое измерение мира должно найти выражение и гарантию в конкретных юридических инструментах гражданского общества: в договорах, соглашениях, институтах международного сотрудничества. Особый упор Иоанн Павел II делает на индивидуальную инициативу каждого участника международных отношений: «Урегулирование неразрешимых на первый взгляд проблем осуществляется зачастую благодаря смелым, решительным инициативам, кладущим начало диалогу в духе взаимопонимания и уважения достоинства каждого из партнёров. Люди, которые проявляют такую инициативу, заслуживают звания «строителей мира» в его евангелевском смысле».
Концепция диалога как признания неотъемлемого человеческого достоинства, уважение жизни каждого человека рассматривается Ватиканом в качестве основы миротворческого дипломатического искусства. Преследуя в первую очередь цели защиты религиозной свободы, папа готов идти на установление дипломатических отношений с любым государством, независимо от существующего там политического режима и социально-экономического строя. В связи с этим Святой Престол, в отличие от светских государств, никогда не выступает инициатором разрыва дипломатических отношений, хотя наличие таких отношений совсем не означает одобрения всех действий властей в их государственной политике. Таким образом, принцип диалога ложится в основу международной политики Католической Церкви.
Инструментом диалога, прежде всего, по словам Иоанна Павла II, является «постоянное стремление постоянно использовать все возможные формулы переговорного процесса, посредничества, арбитража, добиться того, чтобы договорённость превалировала над разногласиями и ненавистью». В зависимости от текущего момента диалог может принимать самые разнообразные конфигурации. В своих выступлениях перед дипломатическим корпусом и слушателями Папской Академии Иоанн Павел II неоднократно говорил о возрастающем значении дипломатии как инструмента международного сотрудничества. Диалог во имя мира особенно значим, когда попирается международное право.
3.2. Участие Иоанна Павла II в разрешении политических конфликтов
16 октября 1978 года, на восьмом этапе голосования конклава, набрав 90 голосов, папой стал польский кардинал Кароль Йозеф Войтыла. Он выбрал себе имя Иоанн Павел II. Обращаясь, после провозглашения папой, к народу, Войтыла говорил: «Я принял также имена, которые были выбраны моим возлюбленным Предшественником Иоанном Павлом I, я хочу тем самым, как и он, выразить свою любовь к единственному в своем роде наследию, оставленному Церкви Папами Иоанном XXIII и Павлом IV и вместе с тем мою личную готовность продолжать их дело с Божьей помощью».
Инаугурация Иоанна Павла II, 264 -го Епископа Рима, началась 22 октября 1978 года, с того, что новый папа преклонил колени у гробницы апостола, расположенной в крипте собора Святого Петра. В своей первой проповеди перед миллионами паломников, он говорил: «Не бойтесь! Откройте двери Христу!» [Приложение 2].
Главной своей задаче и «непреложной обязанностью» новый папа считал воплощение в жизнь решений Второго Ватиканского Собора. Он хотел посвятить своё пребывание на посту первосвященника благородной цели христианского единства, а также выполняя миссию Церкви в современном мире, способствовать укреплению мира и справедливости в отношениях между народами, уделяя особое внимание религиозной свободе.