Празднование Всемирного дня молодёжи ускорило ритм Католической Церкви. Одной из важных встреч Иоанна Павла II была встреча с молодыми мусульманами в Касабланке, Марокко, в августе 1985г. Это было беспрецедентное событие. Папа официально обратился к мусульманской аудитории по приглашению мусульманского лидера, произошло это в последний день паломничества папы в Африке. В ходе этой миссии понтифик также посетил Того, Берег Слоновой Кости, Камерун, Центральную Африканскую Республику, Заир и Кению, где принимал участие в Международном евхаристическом конгрессе, проходившем в Найроби. Остановка в Касабланке была сделана по личному приглашению Короля Марокко Хасана II, который пригласил папу ещё во время королевского визита в Ватикан. Иоанн Павел II принял это приглашение: этот визит стал первым и единственным официальным приглашением, заключённым между Святым Престолом и исламским государством. В письме Короля Хасана II говорилось, что Католическая Церковь в Марокко может проводить богослужения и осуществлять религиозное образование и что церкви и католические школы освобождаются от налогообложения. Католической Церкви предоставляется полный контроль над её внутренними делами в Марокко. Церковь могла получать финансовую помощь как внутри страны, так и из-за рубежа и управлять своими собственными финансовыми делами. Была разрешена также деятельность католических благотворительных объединений.
Иоанн Павел II в начале 1986 года посетил Индию. Папа много раз пересекал этот огромный субконтинент, начав с Дели и посетил Калькутту, ранчи, Шиллонг, Мадрас, Гоа, Мангалупу, Тричур, Кочин, Эрнакулам, Вераполи, Бомбей и т.д. В день прибытия в Индию понтифик посетил место кремирования Махатмы Ганди (1948г) и вознёс молитву заповедей блаженств. Христианская служба для бедных была постоянной темой проповедей Иоанна Павла II. Так он встретился с матерью Терезой, которая за долгие годы своей деятельности привела около пятидесяти тысяч больных индейцев, живших под открытым небом, в созданный ею «Дом чистого сердца». Дружба между Папой – поляком и монахиней родом из Албании была глубокой и проникновенной: они понимали друг друга без слов. Для папы мать Тереза была воплощенным «живым посланием» современному миру. Поражало то, что основанная Терезой община религиозных женщин, преданных своему трудному делу, процветала и расширялась, в то время как другие общины распадались. Иоанн Павел II решил, что данное свидетельство должно быть увидено в Риме. Позже папа создал в Ватикане приют «Dono di Maria» (Дар Марии), который был открыт 20 мая 1988 года. То, что благотворительная община матери Терезы успешно функционировала в Индии, где христиане составляли меньшинство религиозного населения, придало Католической Церкви значимость в индийском обществе. Мать Тереза и её сёстры воплощали два общих качества – сострадание и глубокое уважение к человеческому достоинству бедных. Они реализовали эти общие, универсальные христианские качества в своей конкретной, частной работе. Одной из ярких новаторских инициатив Иоанна Павла II был Всемирный день молитвы о мире с участием некатолических и нехристианских религиозных лидеров со всего мира. Противники в Курии по данной инициативе считали, что такая общая молитва означает синкретизм. Однако, для папы, собраться вместе для молитвы означало нечто иное. Комиссия по справедливости и миру выработала процедуру, согласно которой каждый участник мог молиться по – своему и затем соединиться с остальными. Также рассматривалась идея поста и паломничества. Всемирный день молитвы состоялся 27 октября 1986 года в Ассизи (Италия). Эта встреча имела огромный успех и в будущем проводилась ещё в 1999 и 2001 гг.
Второй Ватиканский Собор породил больше всего надежд на перспективу экуменического диалога между как католиками и англиканами. Эти надежды основывались на историческом предположении, что английская реформация фундаментально отличается от Реформации в остальной Европе. В противоположность разделению католиков с лютеранами и реформистскими христианами в континентальной Европе, полагали некоторые, не было трудностей в вероучении, разделявшем Церкви Рима и Англии теперь, в XXв., поскольку подобное разделение в XVIв. было скорее политическим, нежели религиозным. Эта точка зрения подтверждалась возникновением в XIXв. англо-католического движения, утверждавшего, что англиканство, как и римское католичество и восточное православие, были ветвями одной католической Церкви. Диалог англиканства с римским католичеством имел за собой большую историю, включая «Конференцию Малинеса» в Бельгии в 1920-х гг., возглавлявшуюся лордом Галифаксом и Примасом Бельгии, кардиналом Дезире Мерсьером. Память об этих первоначальных попытках восстановления единства привела к диалогу, формально установленному после Второго Ватиканского Собора под эгидой Англиканско-Римской католической международной комиссии (ARCIC).
После совместного подготовительного совещания на Мальте в 1968 году, этот официальный теологический диалог, известный как ARCIC -1, проводился тринадцать раз с 1970-1981гг. и обсуждал евхаристическую доктрину, вопросы богослужения и посвящения в духовный сан и иерархию Церкви. Его окончательный доклад был представлен Англиканскому консультативному совету и Святому Престолу в 1982 году. Пока результаты встреч рассматривались религиозными лидерами с обеих сторон, в 1983 году была предпринята вторая серия диалога, названная ARCIC-2, имевшая целью обсуждать вопросы спасения и единства Церкви. Диалог Англиканской и Римско-католической Церквей вступал на опасный путь. Рукоположение женщин в духовный сан, совершаемое некоторыми англиканскими Церквями, во всём мире привлекло к себе международное внимание после того, как 1974 году рукоположение в священники женщин началось в США. Православная Церковь считает невозможной такую практику, так как она не предписывалась Писанием и не применялась в церковной традиции. Римско-католическая Церковь подтвердила, что она не может посвящать в духовный сан женщин, издав в 1976 году Декларацию доктрины веры под названием «Inter Insignioris» (Об обычаях нынешнего века). Распространение практики посвящения в духовный сан женщин в англиканской общине, особенно в случае его утверждения Ламбетской конфиренцией 1988 года, может нанести огромный урон по надеждам на церковное воссоединение между Кентербери и Римом.
В июне 1987 года папа дал аудиенцию Президенту Австрии Курту Вальдхайму, и вызвал тем самым критику и необходимость особых консультаций с мировыми еврейскими лидерами, которые прошли в Риме и летней резиденции папы в Кастель-Гандольфо. Вальдхайм был когда – то офицером третьего рейха и никогда не признавал и не выражал публичного раскаяния своей роли в нарушении прав человека в военное время. Представители Комиссии по религиозным отношениям с евреями при Святом Престоле встретились с членами Международного еврейского комитета по межконфессиональным консультациям для обсуждения вопросов Холокоста, современного антисемитизма, учения Церкви о евреях и иудаизме, отношений между Святым Престолом и государством Израиль. Совершился полный и откровенный обмен мнениями. Данная встреча позволила обновить еврейско – католический диалог.
Вселенский Патриарх Константинопольский Димитриос I посетил папу в Риме. Этот визит был отмечен общественностью как высокое достижение усилий Иоанна Павла II в попытках устранить тысячелетние разделение христианства на восточное и западное. Димитриос обращался к Римской Курии, выступал в Латеранском университете, беседовал с молодыми католиками в Церкви Святой Марии в Трастевере. Возможность Церкви вновь «дышать двумя лёгкими» (любимая метафора Папы) получила реализацию в двух литургических службах. Но Вселенский Патриарх не мог двинуться дальше, чем предписывает консенсус среди его патриархальных собратьев в Александрии, Антиохи, Иерусалиме, Москве, Афинах, Белграде, Бухаресте и в других патриархиях.
В январе 1990 года прошли консультации Римско – Католической и Православной Церквей в Москве, которые так и не привели к разрешению проблем с возрождающейся Греко-Католической Церковью на Украине.