Сергей Степанович добился выделения дополнительных денежных средств на приобретение для корпусной обсерватории новейших зарубежных астрономических и метеорологических приборов и инструментов.

Заслугой С.С. Нахимова также является организация в Морском корпусе специального физического класса с уникальными по тому времени приборами и оборудованием.

Кроме того, по инициативе директора в учебном заведении оборудовали кабинеты прикладной пароходной механики и корабельной архитектуры. Для этого специально приобрели учебные действующие модели локомотива, фабричной паровой машины и паровой канонерской лодки. По распоряжению адмирала кадеты и гардемарины стали совершать экскурсии на некоторые промышленные предприятия столицы, верфи и в музей Горного института.

Хорошо успевающие гардемарины по распоряжению адмирала С.С. Нахимова в качестве поощрения теперь направлялись на корабли, идущие в дальние плавания.

Военные события Крымской войны и внезапное появление вблизи Санкт-Петербурга объединенной англо-французской эскадры вынудили администрацию Морского корпуса прекратить традиционную летнюю практику на судах учебного заведения. В эти годы кадетские роты вместе со штурманскими кадетами проводили лето в лагере Царского Села, где тогда дислоцировался сводный отряд военно-учебных заведений Санкт-Петербурга. Несколько позже воспитанники Морского корпуса стали проводить лето в лагере вблизи Ораниенбаума, где морская практика для них проходила на большой модели фрегата, установленной на берегу Финского залива.

С началом 1861 года связаны значительные преобразования во всей системе подготовки офицерских кадров для флота. В их основе фигурировали иные начала и критерии. Большинство достигнутых при этом результатов связано с именем бывшего выпускника Морского кадетского корпуса, известного мореплавателя, гидрографа, писателя и реорганизатора системы военно-морского образования Воина Андреевича Римского-Корсакова – человека широких взглядов, высокой внутренней культуры, незаурядного научного и литературного дарования. Его объективную и справедливую характеристику можно обнаружить в «Общем морском списке», систематически публиковавшем в XIX–XX веках подробные сведения о прохождении службы русскими морскими офицерами: «В.А. Римский-Корсаков принадлежал к числу тех личностей, которые одинаково были на месте как на военно-морском, так и на педагогическом поприще.

Моряк не по профессии только, но и в душе, он с самых молодых лет имел возможность, через продолжительные дальние плавания и знакомства с иностранными флотами, особливо с английским, усвоить себе правильный взгляд на морскую службу во всех ее деталях, а при всестороннем изучении этой службы, при твердом энергичном характере, Воин Андреевич заслуженно пользовался на флоте репутацией отличного моряка и лихого командира».

Биограф Воина Андреевича Д.Ф. Мертваго называл его жизненный путь «образцом неуклонного выполнения долга».

Высоко оценивал своего старшего брата и воспитанник корпуса, морской офицер и известный русский колшозитор Николай Андреевич Римский-Корсаков. По его мнению, это был «превосходный моряк, беспристрастный и прямой человек».

Заслуги знаменитого русского моряка, мореплавателя, гидрографа и географа, исследователя Татарского пролива и Амурского лимана, побережья Сахалина и других территорий Дальнего Востокя широко известны. Его имя увековечено на географической карте мира названиями островов в Японском море и в заливе Петра Великого.

В сентябре 1857 года В.А. Римский-Корсаков вернулся в Кронштадт и был встречен с почетом руководством флота. Его заслуги перед Россией очевидны. По распоряжению морского министра великого князя Константина Николаевича Воина Андреевича назначили в феврале I860 года начальником штаба главного командира Кронштадтского порта вице-адмирала Ф.М. Новосильского.

В июньском номере «Морского сборника» за I860 год опубликовали очередную статью капитана I ранга В.А. Римского-Корсакова «О морском воспитании». В ней моряк обобщил богатый опыт своих коллег и высказал собственные взгляды на сложную проблему подготовки морских офицеров. Он считал необходимым с первых же классов обучения в Морском корпусе воспитывать у будущих морских офицеров любовь к флотской службе, чувство коллективизма, товарищества и самостоятельности в принятии оперативных решений. Воин Андреевич писал: «Руководствуясь примером корпусных фрегатов, не мешает, чтобы часы еды и отдыха установлены были по-морскому; даже артельная миска и деревянная ложка ничему бы не вредили, а между тем это избавило бы от посудного хлама и добавило прислуги.

Команды на этом судне следовало бы иметь не более тою, сколько нужно содержания всего в чистоте без участия воспитанников. Команда должна бы состоять из бывалых, хорошего поведения матросов, которые при случае могли показать воспитанникам, как управляться со шлюпкой, как закинуть сеть, как вымыть ружье и проч.».

В статье опытного моряка прослеживается идея главного в воспитании кадетов – они не должны чувствовать себя на корабле белоручками, отдаленными от нижних чинов броней сословных предрассудков. Он прекрасно понимал, что в плавании или в бою все члены экипажа, офицеры и матросы, всегда составляли одну сплоченную семью, один коллектив, разделяющий все тяготы флотской службы. Воин Андреевич на своем жизненном опыте убедился, что только сплоченная, дружная команда из людей инициативных, выносливых, знающих свое дело, готовых прийти на выручку и заменить в трудную минуту товарищей, способна победить и справиться с любыми трудностями.

Римский-Корсаков являлся противником мелочного и сурового надзора за воспитанниками. В статье он писал, что «совершенно без надзора нельзя оставлять мальчиков, особенно в большой массе, но мне кажется, что с терпением и умением можно устроить этот надзор так, чтобы он не тяготел над ними, а именно заставил их самих надзирать за собой. Необходимо учитывать индивидуальные качества воспитанников, считаясь с их способностями и интересами.

Серьезное внимание следует обращать на личность преподавателя-воспитателя, обязанного знать свой предмет, постоянно расширять кругозор и знания. Плохо, если он остановится на том, что приобрел однажды в офицерском классе и, составив однажды навсегда программу своих лекций, будет твердить из года в год одно и то же. Такой преподаватель, значит, не интересуется своей наукой и, следовательно, и не может заинтересовать его воспитанников».

Интересны соображения автора статьи и относительно выпускных экзаменов, которые никоим образом не должны превращаться в формальный акт. Воин Андреевич считал, что Морской корпус «…не выучивает человека окончательно, не делает из него окончательного моряка. Воспитание и образование должны завершаться в процессе дальнейшей службы и практики».

Статья известного моряка и мореплавателя обратила на себя внимание не только опытных флотских офицеров, но и самого морского министра великого князя Константина Николаевича Против четких аргументов и дельных предложений, изложенных в работе капитана I ранга Римского-Корсакова, трудно было что-либо возразить. Руководитель Морского ведомства прекрасно понимал, что теперешнее положение в Морском корпусе плачевно и действительно требует коренных преобразований. В наступавшую эру парового флота и более совершенного его вооружения необходимы были морские офицеры, обладающие принципиально новыми специальными знаниями и профессиональным опытом. Генерал-адмиралу пришла идея подключить к делу воспитания будущих морских специалистов этого энергичного, авторитетного в морских кругах офицера, бывалого моряка и всесторонне образованного человека.

В апреле 1861 года капитана I ранга В.А. Римского-Корсакова приказом морского министра назначили командиром учебного отряда судов Кадетского корпуса.

Вступив в должность, Воин Андреевич для летних плаваний разработал оригинальную программу занятий с воспитанниками. Под его командованием после восьмилетнего перерыва снова вышли в плавание учебные суда: фрегат «Кастор» и винтовой корвет «Баян».