В течение 1940–1941 годов (до Великой Отечественной войны) А. А. Волин принял участие в целом ряде совещаний, проведенных Прокуратурой Союза ССР, а также сам организовал несколько крупных мероприятий, направленных на повышение активности и эффективности прокурорского надзора и следственной работы.
Пожалуй, самые трудные годы для Волина пришлись на Великую Отечественную войну. На третий день после ее начала Прокурор Союза ССР Бочков издал приказ № 57с, где были намечены все узловые вопросы, призванные стать определенной канвой для перестройки работы органов прокуратуры на военный лад. Соответствующий приказ подготовил и А. А. Волин. Напряжение, с каким работал тогда Анатолий Антонович и возглавляемый им аппарат, было очень велико. Заполненные до отказа делами дни, бессонные ночи, ответственнейшие персональные поручения правительства, многочисленные поездки по стране изматывали до предела. И все это в условиях военного времени, когда права на ошибку не было.
В самые трудные годы военного лихолетья в прокуратуре республики рабочий день продолжался с 9 до 24 часов с перерывом для отдыха с 18 до 20 часов. Но нагрузка была такова, что люди не укладывались и в этот напряженный режим времени. Ночевали часто прямо на рабочих местах. Нередко следователи и прокуроры выезжали в командировки не только по своим служебным делам, но и по заданиям партийных и советских органов. Осенью 1941 года вместе с другими центральными органами Прокуратура РСФСР оказалась в эвакуации. В Москве оставалась лишь небольшая оперативная группа прокуроров и следователей. Часто приезжал в это время в столицу и Анатолий Антонович. Исключительно тяжелыми и напряженными стали для Волина и некоторые поездки по стране в первые годы войны. Случалось, попадал и под бомбежки.
В 20-х числах августа 1948 года А. А. Волину позвонил заведующий управлением кадров ЦК ВКП (б) Бакакин и сказал, что его срочно вызывает к себе А. А. Кузнецов. В пять часов вечера Волин был уже в кабинете секретаря ЦК. Кузнецов принял его приветливо, стал расспрашивать о работе, откуда он родом, какое имеет образование, и после непродолжительной беседы, ничего не сказав о цели вызова, направил к В. М. Молотову. С ним также состоялся непринужденный, но ничего не значащий разговор.
Анатолий Антонович, как человек умудренный большим опытом, понял, что речь может идти о каком-то новом назначении. И, действительно, дня через три-четыре ситуация прояснилась. Волина прочили Председателем Верховного суда СССР, на место Голякова.
О том, как происходило это назначение, А. А. Волин рассказывал: «Через некоторое время я уже сидел за столом Политбюро… Сижу на краю длинного стола. Утвердили какого-то министра. Входит Сталин. Председательствовал, кажется, Маленков. Сталин подошел к столу, что-то на нем посмотрел, что-то спросил у председательствующего и стал прохаживаться. Кузнецов стал докладывать мое дело. Я, естественно, поднялся. Как только Кузнецов кончил докладывать, Сталин посмотрел на меня и говорит: «А не молод ли товарищ Волин?» Мне было 45 лет. У меня был моложавый вид, от силы можно было дать 35 лет. Я сказал: «Мне недавно уже исполнилось 45 лет, товарищ Сталин». Он как-то недоверчиво посмотрел и спросил: «А не тяжело ли Вам будет, товарищ Волин?» Это как бы вытекало из первого вопроса. Я вспомнил, что министр, которого назначали передо мною, пробубнил на такой же вопрос: «Если мне поможет ЦК, я постараюсь оправдать доверие ЦК и ваше, товарищ Сталин». И думаю: как же мне ответить, чтобы не быть попугаем. Я сказал: «Я сознаю, что это нелегко, товарищ Сталин». Он так посмотрел-посмотрел и говорит: «Хорошо». Кто-то из членов Политбюро сказал: «Утвердить». Кузнецов дал мне знак уходить. Больше я с ним (Сталиным. — Авт.) не встречался. Но видел его десятки раз на приемах. Я был на всех приемах».
25 августа 1948 года Президиум Верховного Совета СССР избрал А. А. Волина Председателем Верховного суда СССР, а очередная сессия Верховного Совета утвердила его в этой должности. Руководителем высшего судебного форума А. А. Волин прослужил два конституционных срока. Он много сделал для того, чтобы решительно повысить уровень судебной работы в стране, обеспечить возможность более быстрого пересмотра судебных дел, по которым были допущены извращения законности в той или иной форме, а также условия для более углубленного изучения судебной практики и дачи суда м необходимых руководящих указаний. Для этого пришлось не только навести должный порядок в аппарате Верховного суда СССР, но и разработать и внести на рассмотрение директивных органов целый ряд законопроектов, направленных на демократизацию судебного процесса. Надо сказать, что проходили они с большим трудом, и далеко не сразу была оценена прогрессивность взглядов на судебную систему нового Председателя Верховного суда СССР.
Все осуществленные структурно-организационные мероприятия оказали исключительно большое влияние на улучшение дела отправления правосудия в стране. К тому же они подкреплялись и другим: увеличился штат Верховного суда ССР, улучшились условия работы и материального обеспечения судебных работников и т. п. Много было сделано и для углубленного изучения судебной практики, что дало возможность направить на места целый ряд принципиально важных руководящих указаний. Анатолий Антонович всегда твердо отстаивал независимость судебных органов, старался не допускать неправомерного вторжения других органов в дело правосудия.
А. А. Волин неоднократно поднимал перед ЦК КПСС и Советским правительством вопросы совершенствования судебной деятельности, внося очень смелые для тех лет предложения. В частности, в мае 1956 года им была направлена записка в ЦК КПСС (доложена лично Н. С. Хрущеву) о необходимости активизации роли защиты в деле отправления правосудия. Речь в ней шла об участии адвоката в предварительном следствии со стадии предъявления обвинения. Н. С. Хрущев согласился с этим предложением, но в силу того, что все правоохранительные органы высказались против такого расширения прав адвокатуры, оно тогда не прошло. Только спустя много лет это прогрессивное предложение Волина получило законодательное разрешение.
В конце 1956 года было разработано и представлено в Президиум Верховного Совета СССР новое Положении о Верховном Суде СССР, над которым А. А. Волин лично исключительно много работал. Оно вступило в силу в феврале 1957 года.
21 февраля 1957 года А. А. Волин был освобожден от должности Председателя Верховного суда СССР. На некоторое время Анатолий Антонович остался не у дел. Вскоре ему предложили занять должность заместителя министра культуры СССР, но он, не считая себя компетентным в этих вопросах, отказался. Но тут вдруг открылась вакансия заместителя главного арбитра в Государственном арбитраже при Совете Министров СССР. На эту должность 25 сентября 1957 года он и был назначен. А. А. Волин, которому было тогда 54 года, энергично принялся осваивать новый для него участок работы. Он активно участвовал в разработке документов нормативного характера, готовил к публикации материалы арбитражной практики, рассматривал споры, возникавшие между хозяйственными организациями, и т. п. Заместителем главного арбитра он прослужил почти 12 лет, до июля 1969 года. После этого в течение ряда лет был консультантом в журнале «Человек и закон».
В 1994 году скончалась жена А. А. Волина Фрида Ильинична, с которой он прожил 60 лет. Сам Анатолий Антонович, несмотря на годы, по-прежнему бодр и энергичен. Он часто выступает с воспоминаниями и статьями в периодической печати, усиленно работает над мемуарами о своей насыщенной богатыми событиями жизни. Волин внимательно следит за тем, что происходит в стране, за работой правоохранительных органов и, конечно же, прокуратуры. Авторы неоднократно встречались с Анатолием Антоновичем в его уютной квартире на Тверской улице. Неспешно текла беседа о прожитом и пережитом, о днях минувших и нынешних. Анатолий Антонович вспоминал о людях, с которыми приходилось встречаться в своей жизни. Всем давал лаконичную, но очень яркую и точную характеристику.