27 мая 1994 г. Казахстан подписал рамочный документ «Партнерство ради мира», а уже в декабре того же года он представил в НАТО проект соглашения с предлагаемыми направлениями сотрудничества, которые включали в себя: планирование и финансирование национальной обороны, обеспечение демократического контроля над вооруженными силами, обучение военных кадров, совместное планирование и проведение учений по поддержанию мира и осуществлению гуманитарных операций. В ноябре 1996 г. был открыт офис Республики Казахстан в группе по координации партнерства по линии НАТО в г. Монс (Бельгия). В июле 1996 г. между сторонами были подписаны соглашения о безопасности и статусе вооруженных сил. Первое касается защиты секретной информации, обмен которой происходит в рамках сотрудничества по программе ПРМ. Во втором соглашении оговаривается статус воинских подразделений стран — партнеров по ПРМ на территории друг друга в случае проведения военных учений и т. п.
В настоящее время сотрудничество Казахстана и НАТО проходит согласно индивидуальной программе партнерства, которая была подписана в 2000 г. В этой программе Астана в качестве первоочередной задачи преследовала цель расширить сотрудничество с Брюсселем в сфере военного строительства и подготовки кадров.
После установления связей между НАТО и Казахстаном многие представители военного командования этой республики прошли обучение в военно-учебных заведениях НАТО — в Риме (Италия) и Обераммергау (Германия), Центре стратегических исследований и оборонной экономики им. Дж. Маршалла в городе Гармиш-Партенкирхен (ФРГ) и других.
Начиная с 1995 г. казахстанские офицеры получили возможность присутствовать в качестве наблюдателей на различных учениях в рамках программы ПРМ. Полученный опыт был использован при создании Центральноазиатского миротворческого батальона (Центразбата) по инициативе президентов Казахстана, Узбекистана и Кыргызстана, который представлял собой в определенном смысле альтернативу сотрудничеству с Россией. В 1997 г. впервые в центрально азиатском регионе на территории Казахстана и Узбекистана прошли крупномасштабные (более тысячи военнослужащих) учения «Центразбат-97» с участием военнослужащих США, Казахстана, Кыргызстана и Узбекистана и стран — партнеров по программе ПРМ: России, Турции, Грузии, подразделений Балтийского батальона. В том же году с территории США на территорию республики была переброшена оперативно-тактическая группа военнослужащих сводного взвода Центразбата и 82-й воздушно-десантной дивизии США.
В соответствии с положениями соглашения от 20 января 1998 г. было открыто представительство Казахстана в Брюсселе. Отдел НАТО по научным и природоохранным делам выделил средства для фундаментального исследования нефтегазового потенциала Каспийского сектора Казахстана. Эксперты НАТО должны уточнить запасы нефти и газа в этой республике, а также возможности по их добыче и переработке. НАТО берет на себя функцию обеспечения безопасности добычи и транспортировки запасов энергетического сырья. В марте 2003 г. альянс включил эту страну в зону ответственности своего южноевропейского командования.
Казахстан разрешил использование авиацией коалиции своих аэропортов в экстренных случаях. Активизируется НАТО и в отношении контроля за акваторией Каспия. Со своей стороны, стремясь стать региональным центром силы, Казахстан укрепляет вооруженные силы и, в частности, создает свой военно-морского флот, который необходим для охраны нефтеносных районов каспийского шельфа. Кроме того, военные суда требуются для конвоя танкеров к портам Ирана и Азербайджана.
По сообщениям СМИ, Турция окажет помощь Казахстану в строительстве нескольких крупных военных судов. Страны НАТО обещали выделить необходимые средства на создание казахстанского ВМФ. Вашингтон обещал оказать содействие в оборудовании военно-морских баз на Каспии. Готовить кадры для флота Казахстана будут в Турции, Греции, Италии и Испании. На льготных условиях Казахстану поставлены самолет С-130 и 4 вертолета «Хьюи-2». В целом Казахстан постепенно переориентирует направление своих военных и военно-технических контактов с России на США и другие страны НАТО.
Кроме того, наблюдается все большее дистанцирование Казахстана от России в некоторых вопросах внешней политики. Так, Астана не поддержала инициативу Москвы о сотрудничестве ОДКБ с НАТО на коллективной основе. Казахстан, демонстрируя свою лояльность США, послал свои воинские подразделения в Ирак. Существует вероятность того, что Казахстан выйдет из объединенной системы ПВО СНГ. Уже несколько лет он не участвует в совместных учениях войск ПВО в Ашулуке. Казахстан рассматривает вопрос о модернизации своей системы ПВО с помощью британской компании. Сумма контракта может составить 1 млрд долл. Тендер, по результатам которого будет подписан контракт, планируется провести в 2010 г.
Одним из приоритетных направлений сотрудничества Казахстана и НАТО являются планирование действий в чрезвычайных ситуациях и управление кризисами. В рамках этого направления на территории республики были проведены региональные курсы по гражданскому чрезвычайному планированию и сотрудничеству между военными и гражданскими структурами. Они были организованы совместно Дирекцией НАТО по гражданскому чрезвычайному планированию, ее отделом по сотрудничеству между военными и гражданскими структурами и Агентством по чрезвычайным ситуациям Республики Казахстан.
Важным направлением двустороннего сотрудничества является взаимодействие в научной области. В ходе визита генерального секретаря НАТО в Казахстан 10, 11 марта 1997 г. были определены перспективы взаимодействия в сфере науки и охраны окружающей среды, в решении экологических проблем Казахстана (Семипалатинск, Арал). Казахстан участвует в программе НАТО «Наука ради мира», которая позволяет получить финансовое содействие в осуществлении ряда проектов. Некоторые из них получили одобрение экспертов Научного комитета НАТО (оба по проблемам ядерной и химической безопасности). В рамках программы «Наука ради мира» специалистами НАТО и МАГАТЭ был проведен анализ радиоактивного заражения местности в районе бывшего советского ядерного полигона в Семипалатинске (Казахстан), где было проведено 239 подземных ядерных испытаний. Кроме того, в 1953 г. этот район попал в радиус действия наземного взрыва водородной бомбы. Правительство Казахстана обратилось к международным учреждениям за финансовой и технической поддержкой для эффективного решения экологических проблем Семипалатинского полигона. Не умаляя важности решения этой сложной задачи, представляется, что анализ уровней радиоактивного заражения местности может иметь не только гуманитарное, но также и чисто военное измерение, связанное с прогнозированием последствий применения ядерного оружия.
Еще одним направлением сотрудничества Казахстана с НАТО, имеющим двойное значение, является создание так называемой Виртуальной шелковой магистрали — спутниковой сети, призванной обеспечить подключение к Интернету работников науки и образования восьми стран Южного Кавказа и Центральной Азии. В целом деятельность Организации Североатлантического договора в научной области может представлять собой инструмент, позволяющий поставить научный потенциал постсоветских государств, в частности Казахстана, на службу альянсу.
Таким образом, для Казахстана сотрудничество с НАТО является альтернативным (помимо ОДКБ и двустороннего российско-казахстанского сотрудничества) фактором укрепления своих вооруженных сил, а также обеспечения безопасности на региональном уровне. Дальнейшее расширение этого сотрудничества может привести к ограничению отношений Казахстана с Россией и другими странами — участниками Договора о коллективной безопасности. В частности, нельзя исключать полностью возможности возникновения ситуации, при которой российские военные объекты в Казахстане (радиотехнический узел на о. Балхаш, полигон ПРО в Сарышагане, 5-й испытательный полигон в Байконуре) окажутся в кольце военных баз НАТО, в результате чего провоз российских военных грузов придется согласовывать с представителями альянса.