Образование уездных ЧК на территории Казахстана развернулось лишь в 1919 году. В первой половине января создана Токмакская[7], в мае — Темирская[8], в июне — в большинстве городов и уездов Сырдарьинской области, к началу сентября действовали Гавриловская, Пржевальская[9] и с 3 сентября Джаркентская (первым председателем ее был С.Н. Жмутский)[10], в октябре — Орская и Кустанайская[11]. В Оренбургской губернии образование уездных ЧК было завершено в 1920 году.
Часть местных ЧК в мелких городах и там, где оперативная обстановка не требовала этого, на основании постановления ВЦИК от 24 января 1919 года была ликвидирована. Ответственность за поддержание порядка в таких уездах и городах была возложена, на губЧК, которые оперативное обслуживание вели через командируемых уполномоченных.
В уездах со сложной оперативной обстановкой ЧК были сохранены. 11 января 1920 года по решению коллегии ВЧК чекистская работа в уездах была возложена на начальников милиции, а 16 января, этого же года президиум ВЧК принял решение о создании при уездных органах милиции политотделов, получивших затем название политбюро. Они создавались специальными комиссиями, состоявшими из членов губкомов партии, представителей губисполкомов, председателей губЧК и начальников уездных органов милиции.
Руководство работой политбюро возлагалось на начальника милиции, которым, согласно указанию В.И. Ленина, мог быть только коммунист с партстажем не менее двух лет[12]. Например, политбюро Петропавловской, милиции было образовано в июне. 1920 года, начальником милиции был назначен бывший председатель Омской губЧК И.В. Ельпединский, член партии с 1911 года. Атбасарское политбюро, образованное в июле. 1920, года, возглавил бывший уполномоченный Омской губЧК В.В. Бокша, Джаркентская уездная ЧК преобразована в политбюро 17 марта 1920 года и Актюбинская — в августе 1921 года. Процесс, образования политбюро, которых было создано 24, по числу уездов, закончился в 1922 году.
23 апреля 1921 года Президиум ЦИК республики утвердил Положение о ЧК Киргизской. (Казахской) АССР и ее коллегию в составе товарищей Мороза, Бабикова и Арганчеева. В положении указывалось, что Киргизская Чрезвычайная Комиссия по борьбе с контрреволюцией, спекуляцией и преступлениями, по должности, подчиняется во всех отношениях ВЧК. В район ее деятельности входит вся территория КАССР, ей подчинены Оренбургская, Актюбинская, Кустанайская, Уральская, Букеевская, Семипалатинская и Акмолинская ЧК.
Во главе Киргизской Чрезвычайной. Комиссии стоит полномочный представитель ВЧК по Кирреспублике, назначаемый ВЧК по согласованию с Кирсовнаркомом, и коллегия из двух членов, также назначаемых ВЧК по согласованию с Кирсовнаркомом. В августе 1921 года полномочным представителем ВЧК был назначен И.К. Даниловский.
Партийное руководство органами, госбезопасности в. республике особенно усилилось после, создания Казахстанской организации РКП(б). 11—18 июня 1921 года в Оренбурге состоялась Первая Казахстанская, партийная конференция. Она избрала областной, комитет (Киробком), в состав которого вошли А.Д. Авдеев, А.М. Асылбеков, А.Т. Джангильдин, Г.А. Коростелев, М.М. Костеловская, С.М. Мендешев, М.М. Мурзагалиев, В.А. Радус-Зенькович и другие[13].
Полномочное представительство ВЧК, затем ОГПУ под руководством и с помощью партийных органов проделало большую работу по укреплению чекистских органов в Казахстане, туда было направлено большое число коммунистов. Например, Акмолинская партийная организация мобилизовала для работы в ЧК по 6—7 коммунистов от каждой партийной организации. Уральский губком партии только в 1921 году направил в ЧК 40 коммунистов.
18 сентября 1921 года в подчинение Казахской ЧК были переданы Акмолинская и Семипалатинская ЧК, а позднее политбюро ряда других областей. Таким образом, к концу 1922 года завершилось образование органов госбезопасности Казахстана.
Одновременно, несмотря на трудности, благодаря повседневному вниманию партийных и советских органов в республике были сформированы части войск при органах ЧК. В частности, к началу сентября 1921 года — батальоны в Алма-Ате, Семипалатинске, Уральске, Петропавловске, Гурьеве, два железнодорожных батальона в Оренбурге, отдельные кавэскадроны — в Актюбинске и в Кустанае, киркавполк — в поселке Надеждинский Акмолинской губернии. К началу 1922 года в войсках ВЧК насчитывалось 1793 казаха.
Начальником управления войск ВЧК в Казахстане был назначен С.И. Воротков, член РКП (б) с 1920 года, комиссаром — бывший военком командных курсов М.А. Башилов, член РКП (б) с 1914 года.
Периферийные органы ЧК в Казахстане, созданные местными партийными органами и Советами, совместно с Омской, Челябинской, Свердловской, Оренбургской, Уральской, Туркестанской и Сырдарьинской ЧК, действовали в исключительно сложной обстановке, в условиях интервенции и гражданской войны. Велась борьба с белогвардейскими армиями и бандами, охватившими огненным кольцом фронтов территорию республики и пытавшимися задушить большевизм, власть Советов и здесь, в казахской степи. Войска Колчака наступали на севере и северо-востоке, а также на территории центральных уездов Степного края; армии Дутова, Бакича и Толстова — на северо-западе, Анненкова — на востоке и в северном Семиречье, С юга большевистским Советам Семиречья и Сырдарьинской области угрожало Кокандское «автономное» националистическое правительство, связанное с турецкими и английскими империалистами и принявшее предложение Дутова о вступлении в «юго-восточный союз» в борьбе против Советской России. Отторжение от нее Средней Азии и превращение ее в колонию английского империализма было целью этого «правительства»,
В тесном союзе с силами контрреволюции активно действовали казахские буржуазные националисты и их воинские части — так называемая «народная милиция». Белогвардейцы и алашордынцы, опираясь на всестороннюю помощь иностранного капитала, организовывали массовый саботаж, заговоры, мятежи, вели активную подрывную шпионскую работу и антисоветскую пропаганду. Особым зверством отличались действия их карательных отрядов. Они уничтожили многих партийно-советских работников, варварски казнили военного комиссара — героя казахского народа Амангельды Иманова, командира партизанского отряда, председателя Кустанайского Совета Л.И. Тарана, а также крестьян аула № 8 и села Таловки Уральской области, выступивших против местных баев и чинимого ими произвола; жестоко подавили ряд антиколчаковских восстаний, в том числе Мариинское в Атбасарском уезде и т.д.
Вместе с молодыми вооруженными силами Советской власти — отрядами красногвардейцев, а затем частями Красной Армии чекистские органы республики, войска ВЧК вели настойчивую, самоотверженную, порой незримую, а часто и открытую вооруженную борьбу с врагами социалистической революции в казахских степях.
Немалый вклад в разгром дутовщины в 1917—1919 годах внесли чекисты особых отделов частей Красной Армии.
Широкую известность приобрели операции Семиреченской ЧК в 1919—1920 годах по ликвидации верненского мятежа, по разложению войск Анненкова, Дутова, проводившиеся под руководством Д.А. Фурманова[14], с участием Ураза Джандосова и многих других коммунистов, а также операции по уничтожению в крепости Суйдун Синьцзянской провинции Китая атамана Дутова[15], по ликвидации повстанческого подполья Бойко и вооруженных отрядов этой организации в казачьих станицах Верненского и Джаркентского уездов, готовивших контрреволюционное выступление.
В 1920 году Семипалатинская губЧК предотвратила готовившийся мятеж в Семипалатинске, а затем разыскала и передала в руки советского правосудия 22 участника зверской расправы над 28 коммунарами, организовавшими по совету В.И. Ленина две коммуны в Восточном Казахстане. Опираясь на помощь советских людей, чекисты успешно провели операции по предотвращению и ликвидации мятежей в Акмолинской губернии, Павлодарском и Усть-Каменогорском уездах Семипалатинской губернии.
Особенно крупным был мятеж в Приишимье, охвативший северные уезды Казахстана. Мятежники — эсеры и буржуазные элементы напали на Петропавловск, Кокчетав, Каркаралинск и многие другие уездные и волостные центры, зверски замучили сотни партийных, советских и комсомольских работников, руководителей и членов первых коммун и сельхозартелей. Органы ОГПУ совместно с частями особого назначения (ЧОН) и частями Красной Армии успешно ликвидировали и этот контрреволюционный мятеж.