В результате ноябрьских выборов кандидат от демократов одержал верх над кандидатом от республиканцев с незначительным преимуществом, в 120 тыс. голосов рядовых избирателей (из общего количества 68,8 млн принявших участие в голосовании). Решающую роль в обеспечении победы Кеннеди сыграли, по утверждению прессы, не политическая платформа его партии и не ожидания «энергичного руководства» и обещанной Кеннеди политики «гибкого реагирования» на вызовы внешнего мира, а то, как он выглядел на телевизионном экране. Кеннеди предстояло стать первым в истории страны президентом-католиком.

Перед тем как покинуть Белый дом в январе 1961 г., Эйзенхауэр обратился к американскому народу с прощальным посланием, в котором отметил усиление власти в стране военно-промышленного комплекса, т. е. влиятельной группировки представителей монополистического капитала, контролировавшей производство продукции военного назначения, и связанных с ними политических и военных кругов США. Косвенным признанием действительного наличия в стране такого альянса стал состав назначенного новым президентом кабинета министров.

В правительство вошли в основном люди, располагавшие широкими и влиятельными связями в финансово-монополистических кругах США, либо же преуспевшие на политическом или научном поприще. Министром обороны был назначен бывший президент «Форд мотор компани» Р. Макнамара, министром финансов — представитель банкирского дома Диллонов миллионер Д. Диллон, госсекретарем — бывший президент Фонда Рокфеллера Д. Раск, министром торговли — крупный бизнесмен Л. Ходжес, министром труда — юрист А. Гольдберг, располагавший широкими связями среди лидеров американских профсоюзов. Пост министра юстиции получил родной брат президента Р. Кеннеди. Средний возраст членов кабинета министров и ближайших советников нового президента составлял ок. 38 лет, что соответствовало словам, произнесенным им в день инаугурации: «Факел передан новому поколению американцев».

Первые внешнеполитические шаги Кеннеди были призваны продемонстрировать его намерение безотлагательно взяться за решение наиболее сложных проблем, с которыми сталкивалась страна в последние несколько лет. Уже через три месяца после вступления на пост президента Кеннеди принял решение «покончить с коммунистической Кубой» (к тому времени он знал о существовании в Гватемале лагеря, занимавшегося подготовкой вооруженного вторжения на Кубу). Дальнейшее развитие событий показало, что Кеннеди, подобно Эйзенхауэру, также склонен был рассматривать вторжение на Кубу в качестве единственно возможного решения «кубинской проблемы».

16 апреля 1961 г. президент дал санкцию на начало «операции Сапата». Высадка 1500 специально обученных и вооруженных кубинских иммигрантов-контрреволюционеров на Плайя-Хирон в заливе Кочинос завершилась провалом: они были разгромлены кубинской армией, а значительная их часть была захвачена в плен. Вашингтон не решился санкционировать поддержку вторжения силами американской авиации и военно-морского флота, поскольку в этом случае было бы сложнее скрыть истинную роль Соединенных Штатов от латиноамериканских и европейских государств, возражавших против чьего-либо вмешательство в дела Кубы.

В попытке оправдать авантюристическое решение правительства в американской прессе были инспирированы разъяснения, перекладывавшие всю ответственность за «кубинское фиаско» на ЦРУ и его директора Аллена Даллеса, которые ввели в заблуждение президента разведывательными данными о слабости правительства Фиделя Кастро и неизбежности народного восстания на Кубе. Подобно Эйзенхауэру в случае с самолетом У-2, Кеннеди был вынужден признать свою личную ответственность за провал вторжения «контрас» на Кубу. В отставку были отправлены директор ЦРУ Даллес и еще два ответственных сотрудника, на которых была возложена вина за провал «ответственной операции». Во избежание повторения «кубинской ситуации» в потенциально взрывоопасном латиноамериканском регионе администрация Соединенных Штатов приняла решение о выделении ассигнований на оказание экономической помощи всем странам региона (кроме Кубы). В августе 1961 г. был создан Союз ради прогресса (Alliance for Progress), перед которым была поставлена задача содействия экономическому развитию стран Латинской Америки (основная часть выделенных американским конгрессом на эту цель ассигнований оказалась на швейцарских счетах представителей латиноамериканской элиты).

В сентябре 1961 г. по инициативе президента и согласно решению конгресса был создан Корпус мира (Peace Corps), перед которым была поставлена задача оказания помощи населению развивающихся государств в получении элементарных технических знаний и трудовых навыков. Латинская Америка стала основным объектом деятельности этой организации, имевшей, однако, ограниченные цели и не располагавшей теми средствами, в которых в первую очередь нуждались развивающиеся страны. Уже в начале 60-х гг. в Гватемале, Эквадоре, Гондурасе и Доминиканской Республике произошли государственные перевороты. К власти пришли военные хунты и диктаторы, которые лишь осложнили существовавшие в этих странах экономические проблемы и вызвали еще большую настороженность США в отношении их южных соседей.

Кеннеди больше не был намерен рисковать, явно опасаясь серьезных политических последствий для его администрации и для него лично в случае повторения подобного провала. С 1955 г., т. е. со времени поражения Франции при Дьенбьенфу, США стали готовиться к осложнению ситуации в Юго-Восточной Азии. «Кубинское фиаско» явилось убедительной демонстрацией того, что может произойти в еще большем масштабе в случае очередного поражения в борьбе с коммунизмом. Пересмотру и новому осмыслению подлежала и тактика претворения в жизнь внешнеполитических интересов американского государства. По решению президента особое внимание стало уделяться психологической войне с коммунизмом и его опасной идеологией.

Лаос и Западный Берлин стали очередными этапами большой стратегии Кеннеди, в ходе которых вырабатывалась тактика «гибкого реагирования». В специальном послании конгрессу 25 мая 1961 г. Кеннеди объявил «великим полем битвы за защиту и распространение свободы в наши дни… Азию, Латинскую Америку, Африку и Ближний и Средний Восток, земли поднимающихся народов». В этом послании была изложена также программа мер на случай атомного нападения на США, содержащая призыв к американцам строить убежища, способные защитить их от радиоактивного излучения. В течение целого года американцы оборудовали убежища в многоэтажных домах и небольших коттеджах, в административных зданиях, больницах и школах, запасались водой и консервами. По свидетельству журнала «Тайм», к августу 1961 г. 12 млн американских семей были готовы к самому худшему.

В июне 1961 г. в Вене состоялась встреча между советским руководителем Н. С. Хрущевым и президентом США, в ходе которой обсуждались вопросы разоружения, ситуация в Лаосе и статус Берлина. Согласно документальным источникам и воспоминаниям участников ее подготовки, советская сторона решила проверить реакцию молодого американского президента на оказываемое на него давление. Хрущев в ультимативной форме поставил вопрос об изменении статуса Берлина, так как, с точки зрения советского лидера, ситуация оставалась «нетерпимой», хотя с момента окончания Второй мировой войны прошло 16 лет. Хрущев заявил, что после подписания мирного договора с ГДР права США в Западном Берлине будут пересмотрены, и напомнил, что и Соединенные Штаты подписали в свое время сепаратный мирный договор с Японией. Кеннеди заявил в ответ, что Берлин представляет жизненный интерес для США и, если они позволят себе быть изгнанными оттуда, все их обязательства и обещания превратятся в «пустые бумажки». Как подчеркнул американский президент, уход США из Берлина будет означать уход из Западной Европы. В неофициальной личной беседе с Хрущевым Кеннеди сказал, что в интересах советско-американских отношений не следовало бы ставить Соединенные Штаты перед лицом кризиса, в котором затрагивались бы их столь серьезные жизненные интересы.