В разное время начальниками Калининского штаба партизанского движения были капитан госбезопасности Радченко и майор госбезопасности С.С. Бельченко. В декабре 1942 года для укрепления руководства партизанским движением Калининский штаб партизанского движения сформировал оперативную группу из своих работников. Начальником группы был назначен батальонный комиссар Алексей Иванович Штрахов. Оперативная группа, постоянно находясь в тылу противника, вникала в дела партизан, оказывала помощь в разработке планов боевой деятельности, руководила диверсиями.

В этот период зарождается и крепнет новая, более совершенная и универсальная форма организации партизан — партизанская бригада. В оккупированных областях СССР их были десятки. В Калининской области действовали Калининские партизанские бригады (или КПБ).

С начала лета 1942 года в Идрицкий и Себежский районы начали прибывать отряды спецназначения и опергруппы НКВД, которые подчинили себе стихийно возникшие и разрозненные местные партизанские отряды и группы. После этого партизанская тактика действий стала приобретать рейдовый характер. Большие диверсии стали проводиться объединенными силами нескольких отрядов или бригад, подчинявшихся единому командованию в лице ЦШПД и НКВД под непосредственным руководством их представителей на местах — командиров отрядов спецназначения и оперативно-чекистских групп. Они сыграли огромную роль в организации партизанского движения. Эти отряды представляли собой небольшие подразделения силами до 20 человек и предназначены были для действий в полосе своего фронта с проникновением в глубокий тыл вражеских войск для ведения разведки, организации диверсий на коммуникациях противника, оказания помощи партизанам оружием, взрывчаткой, обучения партизан подрывному делу, координации действий партизан и фронта, руководства партизанским движением в тылу. Большое количество отрядов спецназначения гибло при заброске в тыл врага с парашютами, при переходе линии фронта или в ходе проведения диверсий. Бойцы отрядов не имели документов, удостоверявших их личность, руководствовались только «легендой». Многие погибшие в тылу врага спецназовцы были похоронены не под своими настоящими именами, а фактически остались безымянными. Партизаны между собой называли бойцов отрядов спецназначения «фронтовиками». Несколько подобных групп спецназначения действовало в Идрицком и Себежском районах, например группы Петракова, Чугунова, Бобруся, Прудникова, группа «Максим».

Отбирали людей в отряды спецназначения очень тщательно и только добровольцев, имевших опыт ведения боевых действий, многопрофильных военных специалистов, причем таких, которые бы могли в критических ситуациях все, что имеется под рукой, превращать в оружие. Немцы, узнав о заброске в свой тыл таких подразделений, оставляли решение любых задач и в первую очередь старались уничтожить всех до единого бойцов подразделения, ведущего глубинную разведку. Поэтому, высадившись в тылу противника, командир отряда спецназначения первым делом подчинял себе какое-либо партизанское формирование, которое должно было прикрывать его действия, а в случае возникновения опасности сделать все для спасения «фронтовиков», вплоть до гибели партизанского отряда. Командиры групп специального назначения, опергрупп НКВД, командиры формировавшихся в немецком тылу отрядов и их комиссары имели на руках документы-директивы, заверенные командованием войск фронта или руководством НКВД, которые предоставляли им очень большие полномочия, вплоть до уничтожения на месте командира отряда, отказывавшегося выполнять приказ.

В первое время командиры местных партизан, попавших под жесткую руку спецназовцев, противились рейдовому характеру ведения боевых действий в отрыве от созданных баз и оборудованных лагерей, где партизанские отряды несли лишь функции самообороны своих деревень и серьезного вреда противнику причинить не могли. В то же время и действия спецназовцев были не всегда правильными, особенно когда они стремились без учета специфических местных условий, с ходу, в наикратчайшие сроки создать чуть ли не партизанскую армию, мобилизуя в партизаны всех поголовно и противопоставляя привычной местным отрядам тактике ведения боевых действий в зоне рейдовую тактику. Иногда их решения носили скоропалительный характер и не всегда приводили к желаемым результатам.

Но в целом в очень сжатые сроки представителями Центра была искоренена так называемая «партизанщина» среди рядового и начальствующего состава, понимавшаяся многими как вольница, насаждена жесткая дисциплина, которая поддерживалась в том числе и страхом перед созданными при партизанских бригадах особыми отделами НКВД. Партизанские формирования были очищены от морально и политически разложившихся руководителей, повышена бдительность и боеспособность. В состав всех отрядов вводились оперуполномоченные НКВД, осуществлявшие жесткий контроль за деятельностью командования и рядовых партизан. В отрядах и бригадах были созданы оперативно-чекистские отделы, которые оказали значительную помощь партизанскому командованию по ограждению и очищению от немецкой агентуры и предателей, в начале войны запятнавших себя сотрудничеством с оккупантами.

Естественно, что командиры отрядов и бригад были недовольны жестким прессингом со стороны НКВД. Иногда, получая оперативно значимую информацию от оперативно-чекистских групп, вместо ее быстрого использования в интересах укрепления отрядов, они игнорировали ее. Отдельные командиры пытались вмешиваться в функции оперативно-чекистских групп, подчинить их себе, не оказывали требуемого содействия в проведении оперативных мероприятий, направленных на разрушение немецких коммуникаций. Под разными предлогами они отказывали во взрывчатке и вооружении. За все это они несли потом ответственность по законам военного времени. В конце концов рядом совместных приказов ЦШПД и начальников управлений НКВД оккупированных областей были определены основные задачи оперативно-чекистских отделов и оперативных работников контрразведывательных органов НКВД, забрасывавшихся в тыл противника, которые ни один из партизанских командиров не решился бы нарушить.

Благодаря всему комплексу мероприятий советского правительства и органов НКВД со второй половины 1942 года партизанское движение в оккупированных областях СССР стало быстро расти. О его размахе в Калининской области с лета до середины осени 1942 года говорит выдержка из доклада начальника оперативного отдела ЦШПД полковника С. Г. Соколова:

Накал партизанской войны и согласованные действия белорусских, латышских и калининских партизан осенью 1942 года привели к освобождению от врага большой территории. В тылу немецких войск образовался партизанский край, охватывающий Россонский, Освейский и частично Дриссенский район Витебской области, южную часть Себежского, Пустошкинского, Идрицкого и западную часть Невельского района Калининской области.

2 января 1943 года войсками Красной армии был освобожден город Великие Луки, а через полмесяца была прорвана блокада Ленинграда. С целью стабилизации положения на этих участках фронта немецкое командование приступило к переброске войск. Поэтому с 1943 года начался новый этап партизанской войны. Теперь партизаны стали все чаще проводить свои диверсионные операции крупными силами, объединяя усилия белорусских, российских и латышских партизан. Была прервана связь между гарнизонами, нарушено централизованное управление охранными частями и подразделениями, что вызвало панику среди немцев и их командования. Г. Геринг на совещании с высшими чинами оккупационной администрации в августе 1942 года говорил: «Если выступят 10 партизан с обычными винтовками, то тыловые армейские подразделения сообщают, что выступили целые дивизии. Посмотрите на карту: в каком-нибудь заболоченном лесу находится еще 175-я ударная дивизия. А там наверняка всего лишь дюжина партизан. Где они еще имеют много оружия, так это под Вязьмой и Брянском, где проходили крупные бои…»