В 20—40-х гг. 20 в. на японскую буржуазную философию оказывали сильное воздействие кантианство и гегельянство, а также прагматизм, феноменология и экзистенциализм. Сложился т. н. японский «классический идеализм», представленный Киотской школой. Виднейшие её представители — Китаро Нисида, Хадзимэ Танабэ, Киёси Мики — развивали эклектические концепции в духе западноевропейского идеализма, используя отдельные категории буддийской метафизики. Получили распространение различные философские версии реакционной идеологии «японизма».
После 2-й мировой войны 1939—45 традиционная буддийско-конфуцианская философия окончательно утратила своё влияние. В конце 40-х гг. фактически распалась Киотская школа. В 50-х гг. ведущие позиции занимают экзистенциализм и прагматизм; с 60-х гг. приобретают влияние аналитическая философия и др. новейшие течения современной буржуазной философии. Наряду с т. н. классическими интерпретациями различных течений идеализма появляются их японские варианты — «японский прагматизм», «японский экзистенциализм» и т. п.
Значительное распространение философии марксизма началось в середине 20-х гг. 20 в. В 1932—38 систематическую пропаганду и популяризацию диалектического и исторического материализма вело «Общество по изучению материализма». Большой вклад в развитие марксистской философии внесли Дзюн Тосака и Хироси Нагата. Со 2-й половины 40-х гг. марксистская философия получает ещё большее распространение. Издаются переводы основных философских произведений К. Маркса, Ф. Энгельса и В. И. Ленина. Йосисигэ Кодзаи, Коити Мори, а также Сэкисукэ Мита, Цунэнобу Тэрадзава, Тикацугу Ивасаки, Нодзому Кавамура и др. разрабатывают проблемы диалектического и исторического материализма, выступают с критикой современной буржуазной философии. Философские вопросы естественных наук освещаются в трудах Сёити Саката, Мицуо Такэтани, Сёхей Мияхара и др. Исследования по философии ведутся в крупнейших университетах Токио, Киото, Осаки, Нагой и др. Издаются философские журналы: «Сисо» (с 1893), «Рисо» (с 1927), «Юйбуцурон кэнкю» (с 1932), «Тэцугаку» (с 1951).
Историческая наука. Первые японские письменные исторические хроники появились в 8—9 вв. н. э. Важнейшие из них составлены Ясумаро Оно в 712 — «Кодзики» («Записки древности») и принцем Синно Тонэри в 720 — «Нихон секи» («Анналы Японии»). Обе хроники излагают древнюю историю Японии начиная с т. н. эры богов и содержат наряду с исторически достоверными сведениями, особенно о периоде 5—7 вв., различные мифы, легенды, сказания. С «периода Эдо» (начало 17 в.) и до разгрома японского милитаризма во 2-й мировой войне 1939—45 разделы хроник, посвященные «эре богов», официально признавались в качестве подлинных исторических фактов и использовались для обоснования реакционной националистической теории о божественном происхождении японской нации.
Историческая наука стала зарождаться в Японии в период развитого феодализма. В 10—15 вв. появляются работы, в которых исторические факты освещаются в духе феодальных взглядов. Широкое распространение получают «рэкиси моногатари» (исторические повествования), «кагами» (зеркальные произведения, т. е. отражающие действительность), «мирайки» (пророческие повести), «гунки» (военные повести).
В середине 17 в. был завершен начатый в начале века Радзаном Хаяси исторический труд из 310 томов «Хонтё цугап» («Всеобъемлющее зеркало нашей страны»). Под руководством Мицукуни Токугава, даймё княжества Мито и основателя одноимённой исторической школы, к концу 17 в. были созданы «Хонги» («Основные анналы»), «Рицудэн» («Биографии») и начато написание «Дайниппонси» («Истории Великой Японии»), составившей в законченном виде (к 1906) 397 томов. Написанные с позиций конфуцианства, эти исторические труды отстаивают теорию божеств, происхождения японской нации, но вместе с тем систематизируют и излагают исторические факты с ссылками на достоверные источники. Значительный вклад в историческую науку внёс конфуцианский учёный и политический деятель Хакусэки Араи (1657—1725). В своих работах он на основе сравнительного изучения источников в «Токуси ёрон» («Дополнительные комментарии к истории») впервые предпринял попытку дать периодизацию японской истории, в «Косицу» («Очерк древней истории») рассматривал описание «эры богов» как отражение человеческой истории.
В период кризиса феодализма в противовес неоконфуцианству начинает развиваться «вагаку», или «кокугаку» (национальная наука), представители которой Мабути Камо (1697—1769), Норинага Мотоори (1730—1801) — автор «Кодзиден» («Комментарии к “Кодзики”»), и др. отвергали непререкаемый авторитет китайской неоконфуцианских концепций, идеализировали историческое развитие Японии в древности, обосновывали необходимость замены военно-феодальной диктатуры сёгунов императорской властью.
В период буржуазных преобразований после незавершённой буржуазной революции 1867—1868 историческая наука испытывает сильное влияние европейского позитивизма и просветительства (Укити Тагути, Мицуми Мурота), зарождается буржуазно-либеральное направление. В 1887 учрежден исторический факультет при Токийском университете. В 1889 создано первое историческое общество «Сигаккай». С 1895 началась публикация исторических материалов и документов «Материалы по истории Японии» («Дайнихон сирё») и «Собрание древних исторических документов» («Дайнихон комондзё»).
С конца 19 в. господствующие позиции постепенно занимают японоцентристские националистические концепции истории страны, что приводит к застою исторической науки, от которой требовали безоговорочного признания легендарного периода в качестве действительной японской истории, божественного происхождения императорской династии, расового превосходства японского народа. Изучение истории, особенно древней, было крайне затруднено.
В 20-е гг. 20 в. под влиянием Октябрьской революции в России и распространения среди передовых кругов интеллигенции идей марксизма-ленинизма предпринимались попытки переосмыслить проблемы изучения истории страны, в частности показать роль народных масс, изучить социально-экономические предпосылки революции Мэйдзи и др. важнейших исторических событий (Горо Хани, Ёситаро Хирано, Эйтаро Норо, Сисо Хаттори). Оживляется буржуазно-либеральное направление (Есабуро Такэгоси, Такао Цутия, Сёкити Цуда, Эйдзиро Хондзё, Ивао Кокусё, Эйтаро Тамура, Кэндзо Акияма, Нори Ибара, Гэндзи Курита). Однако в 30-е годы эти учёные практически лишаются возможности высказывать свои взгляды, караются даже незначительные отступления от официальных канонов (например, «дела» Минобэ Тацукити, Эйдзирё Каваи, Тадао Янаибара).
После разгрома милитаристской Я. японские историки впервые получили возможность более свободно изучать историю своей страны, особенно древнюю, выросла источниковедческая база, расширилась проблематика исследований, увеличилось количество публикаций. В исторической науке сложилось и окрепло прогрессивное демократическое течение, многие последователи которого придерживаются марксистских взглядов или близки к ним (Дзёкити Утида, Ёсикацу Фурухата, Сети Фудзи, Синобу Ооэ, Сабуро Иэнага, Сигэки Тояма). Серьёзные позиции в исторической науке послевоенного периода занимает большая группа учёных буржуазно-объективистского направления (Еситакэ Ока, Сэйдзабуро Синобу, Такэси Исида, Тадао Янаибара, Таро Сакамото, Ридзо Такэути, Масаси Исимото). В последние годы увеличивается число публикаций, в которых события японской истории, особенно довоенной, вновь трактуются с националистических позиций (Масаси Надзу, Сигэнои Токо, Сайто Эйсабуро).
Изучение истории сосредоточено главным образом в научно-исследовательских институтах при университетах (Институт общественных наук при Токийском университете, Институт восточной культуры при Токийском университете, Институт общественных наук при университете Васэда в Токио, Институт истории при университете Кюсю в Китакюсю и др.). Имеется много исторических обществ, в том числе Ассоциация японской истории, Научный совет историков (основан в 1967), Общество по изучению истории (основано в 1930). Исторические журналы: «Рэкиси токухон» (с 1952), «Рэкисигаку кэнкю» (с 1933), «Сигакку дзасси» (с 1889), «Ниппон рэкиси» (с 1946) и др.