Суд обстоятельно исследовал доказательства относительно сбора Щаранским лично и через сообщников информации о дислокации и ведомственной принадлежности предприятий оборонных отраслей промышленности и связанных с ними объектов, а также об их руководителях. Все эти сведения Щаранский систематически, вплоть до ареста в марте 1977 года, передавал с соблюдением мер конспирации на Запад.

Было доказано, что Щаранский поддерживал связь с иностранным корреспондентом, который, как установлено компетентными органами, являлся агентом одной из западных военных разведок. Из показаний явствует, что Щаранский в течение 1976 - 1977 гг. неоднократно оказывал ему содействие в установлении на конспиративной основе контактов с советскими учеными и специалистами, обладающими секретными сведениями. Щаранский помогал этому агенту в сборе разведывательной информации, в частности проводя целенаправленные опросы ничего не подозревавших людей. По заданию иностранного шпиона Щаранский лично опросил одного из советских ученых по вопросам развития в СССР генной инженерии, о перспективах этой науки, а также получил сведения о том, какие учреждения занимаются данными проблемами.

При содействии Щаранского агент военной разведки имел несколько встреч с советским ученым, располагавшим секретами, и пытался добыть от него сведения о конечных результатах закрытых исследований. На последней встрече при получении таких материалов иностранец был задержан с поличным.

Суду были представлены многочисленные доказательства преступной деятельности Щаранского: подлинник письма от агента иностранной разведки с заданием собирать разведывательную информацию; специальная анкета, содержащая перечень вопросов разведывательного характера (на обороте этого документа от руки было написано письмо, обращенное лично к Щаранскому). Суд ознакомился с заключениями ряда экспертиз, с официальными документами о пребывании в СССР иностранцев, с которыми подсудимый состоял в преступной связи, и их сотрудничестве с иностранными разведывательными органами.

Судом было установлено, что Щаранский подготовил и направил за границу не менее семнадцати документов-фальшивок, которые были использованы на Западе во враждебных Советскому государству целях. Это так называемые обращения, обзоры и письма, основанные на клевете, которые подстрекали к антисоветской деятельности. Щаранский таким способом всячески стремился подталкивать политические круги Запада к оказанию давления на Советский Союз и вмешательству в его внутренние дела. Из материалов, фигурировавших на процессе, явствует, что таким образом Щаранский стремился нажить политический и денежный капитал. Таким способом он готовил себе безбедную жизнь за границей, собираясь уехать из СССР.

Летом 1975 года Щаранский совместно с двумя соучастниками встречался с группой американских сенаторов, посетивших Советский Союз. Эта встреча происходила в номере московской гостиницы "Россия" как раз накануне приема американских законодателей советскими официальными лицами. Для того чтобы испортить атмосферу предстоящей встречи, возбудить враждебность и настроить сенаторов против каких-либо конструктивных шагов в отношениях с советской стороной, Щаранский вручил им фальсифицированный "обзор" о положении евреев в Советском Союзе. Здесь содержались клеветнические измышления об "антисемитской кампании фашистского толка" в Советском Союзе, якобы "поощряемой центральными властями". Эти дикие измышления развязали руки наиболее оголтелым противникам СССР на Западе. Их распространение, безусловно, подталкивало экстремистские элементы, в частности из так называемой лиги защиты евреев в США, к террористическим антисоветским акциям.

"Подсудимый Щаранский, - обратился к нему государственный обвинитель во время процесса, - в своих материалах вы много раз писали, что евреи в СССР подвергаются дискриминации. Имела ли когда-нибудь место дискриминация вашей семьи?" На этот вопрос Щаранскому нечего было ответить, и он промолчал. Тогда обвинитель зачитал официальную справку о том, что отец, мать и брат Анатолия Щаранского, так же как и он сам, получили в СССР высшее образование. Все работали по специальности. Сам Щаранский после окончания института работал инженером, а затем старшим инженером в оборонной научно-исследовательской организации. Его не обходили при продвижении по службе. Ему оказывалось доверие: он был допущен к важным секретам Советского государства. Ни Щаранский, ни его семья никогда не подвергались какой-либо дискриминации.

"В материалах, переправленных" на Запад, вы неоднократно писали, что советские евреи, подавшие заявления на выезд в Израиль, немедленно лишаются работы. Произошло ли это с Вами лично после подачи такого заявления?" - таким был еще один вопрос прокурора. Щаранский ответил, что с работы его никто не увольнял. Он сам перестал ходить на службу, поскольку она отвлекала его от "общественной деятельности".

Щаранский участвовал в изготовлении двух клеветнических писем к американским сенаторам и конгрессменам о преследованиях и репрессиях, которым якобы подвергаются желающие выехать из СССР. Государственные деятели Запада побуждались подобными материалами к вмешательству во внутренние дела Советского Союза. Очевидно, что Щаранский стремился в интересах сионистских кругов стимулировать выезд евреев из СССР, разжигал национальную рознь и призывал к нажиму извне на советские власти. Так, в беседе с одним из лидеров международной сионистской организации "Сохнут" Лерманом, приезжавшим в Москву в сентябре 1975 года, Щаранский убеждал его использовать все возможности международного сионизма для того, чтобы заставить Соединенные Штаты прекратить поставки зерна в Советский Союз. Речь шла, таким образом, об организации экономического давления на Советское государство.

В феврале 1976 года Щаранский участвовал в подготовке и распространении среди представителей западных государств в Москве письма, адресованного конференции сионистов в Брюсселе. Письмо это содержало заведомо ложные сведения об "усилении антисемитизма и дискриминации евреев в СССР". Под этим предлогом международные сионистские организации призывались к вмешательству во внутренние дела Советского Союза, к причинению ущерба его интересам и авторитету.