30 июня 1941 г. с целью централизации руководства мобилизацией всех сил страны на отпор врагу совместным решением ЦК ВКП(б), Президиума Верховного Совета СССР и СНК СССР был образован Государственный Комитет Обороны (ГКО) во главе с И. В. Сталиным. В состав ГКО вошел ряд членов и кандидатов в члены Политбюро ЦК ВКП(б). Прообразом этого чрезвычайного высшего государственного органа был Совет Рабочей и Крестьянской Обороны, созданный в годы гражданской войны для защиты молодой Советской республики от натиска белогвардейцев и интервентов и с честью выполнивший возложенные на него обязанности. Основные направления работы этих чрезвычайных высших органов власти были аналогичными, но функции ГКО были более обширными.
Государственный Комитет Обороны, как чрезвычайный орган, сосредоточил в своих руках всю полноту власти в стране. Под руководством ГКО работали Госплан СССР, наркоматы и ведомства, все хозяйственные организации страны. ГКО объединил в одно целое усилия фронта и тыла для обеспечения жизнедеятельности государства и разгрома врага.
Государственный Комитет Обороны осуществлял непосредственное руководство производством важнейших средств вооружения для Красной Армии: танков, самолетов, боеприпасов, снаряжения, а также железнодорожным транспортом. Основные наркоматы военной промышленности возглавляли члены и кандидаты в члены ЦК ВКП(б). В распоряжении Государственного Комитета Обороны имелся специальный институт уполномоченных ГКО. В этих должностях утверждались секретари крупнейших партийных комитетов промышленных краев, областей и центров страны. В обязанности уполномоченных ГКО прежде всего входило оперативное решение вопросов, связанных с организацией и развитием производства военной продукции.
Наряду с этим в ходе войны более чем в 60 городах прифронтовой полосы, таких, как Ленинград, Севастополь, Тула, Ростов, Сталинград, Курск, были созданы городские комитеты обороны, которые осуществляли руководство военной экономикой, координировали деятельность партийных, советских и хозяйственных органов по мобилизации ресурсов.
С целью повышения оперативности в работе тыловых органов, обеспечения необходимой централизации планирования и организации тылового обеспечения Вооруженных Сил СССР 28 июля 1941 г. постановлением ГКО были созданы Главное управление Тыла Красной Армии и управления тыла во фронтах и армиях, а также учреждены должности начальника Тыла Красной Армии и начальников тыла фронтов и армий.
При Бюро Совнаркома СССР был создан специальный Комитет по распределению рабочей силы. Позже на него были возложены функции ее учета. Затем образовался Комитет продовольственного и вещевого снабжения, главные управления по снабжению отраслей народного хозяйства углем, нефтью, лесом.
Перестройка государственного аппарата управления сопровождалась резким сокращением штатов наркоматов, различных учреждений и всего управленческого аппарата. Многие специалисты из учреждений направлялись на заводы и фабрики.
Во время войны в своей огромной работе по созданию и развитию военной экономики ГКО опирался на органы управления хозяйством, приспособленные в условиях войны к обслуживанию нужд фронта; на ЦК компартий союзных республик, крайкомы и обкомы; на создававшиеся городские комитеты обороны в прифронтовых городах, а также на Совет по эвакуации, Комитет по разгрузке транзитных грузов, Комитет по эвакуации продовольственных запасов, текстильного оборудования, мануфактуры, сырья и других товаров широкого потребления и Транспортный комитет при ГКО, координировавший работу всех видов транспорта.
Большую помощь ГКО оказывало Оперативное бюро ГКО. Через этот орган ГКО осуществлял оперативный контроль за выполнением военных заказов. Структура и состав Оперативного бюро претерпевали изменения в зависимости от тех хозяйственных задач, которые решались на том или ином этапе войны. Для быстрого рассмотрения и решения вопросов снабжения, а также для проверки потребности в продовольственных и промышленных товарах и выявления дополнительных товарных ресурсов была создана комиссия при Оперативном бюро ГКО.
Централизованное руководство перестройкой народного хозяйства и развитием военной экономики осуществлял Государственный Комитет Обороны. В поле зрения ГКО находилась работа всех отраслей народного хозяйства, и особенно промышленности, как главной, ведущей отрасли военной экономики, обеспечивавшей нужды фронта и тыла. В ГКО и его органах с участием Госплана СССР и соответствующих наркоматов регулярно рассматривались итоги работы, обсуждались и решались очередные задачи военной экономики. Деятельное участие в этой работе принимал Госплан СССР, ставший экономическим штабом советской военной экономики.
Совнарком СССР 1 июля 1941 г. принял постановление «О расширении прав народных комиссаров СССР в условиях военного времени». Наркомам и наркоматам предоставлялось право самостоятельно решать вопросы распределения и перераспределения материальных и финансовых ресурсов, необходимых для выполнения планов производства и строительства. На местах значительно возросла роль партийных органов. Их усилия были направлены на осуществление скорейшей перестройки народного хозяйства, на всемерное удовлетворение нужд фронта.
Перевод государственного и партийного аппарата на режим военного времени, усиление системы централизованного управления народным хозяйством обеспечили высочайшую мобильность и маневренность военной социалистической экономики.
Коммунистическая партия направила усилия советских людей на превращение страны в кратчайший срок в единый военный лагерь, как учил В. И. Ленин. Огромную роль в мобилизации всех сил советского народа на борьбу с немецко-фашистскими захватчиками сыграла директива СНК СССР и ЦК ВКП(б) от 29 июня 1941 г. В ней подробно излагались политические, идеологические, экономические и собственно военные мероприятия партии и правительства, в комплексе обеспечивавшие успешную борьбу с фашистской Германией.
Выполняя эту директиву, партийные, советские и хозяйственные организации развернули громадную организаторскую и военно-мобилизационную работу среди населения. Она обеспечила проведение ряда крупных военно-мобилизационных мероприятий, и в частности введение обязательного военного обучения и всеобщей обязательной подготовки населения к противовоздушной обороне.
Еще до войны, когда угроза военного нападения гитлеровской Германии на Советский Союз стала реальной опасностью, Советское правительство приняло мобилизационный план по боеприпасам на вторую половину 1941 и на 1942 г. В этом плане предусматривались мероприятия по перестройке работы промышленности, и особенно предприятий машиностроения, в условиях военного времени. В план были заложены конкретные задания предприятиям — по выпуску боеприпасов; по разработке технологии их производства (исходя из имевшегося на предприятиях оборудования); по изготовлению приспособлений, технологической оснастки и инструментов для выпуска боеприпасов; по созданию мобилизационных запасов материалов и полуфабрикатов, необходимых для обеспечения заданной программы производства боеприпасов.
Через неделю после начала войны ГКО утвердил первый план военного времени — Мобилизационный народнохозяйственный план на третий квартал 1941 г., который заменил принятый до войны план развития народного хозяйства на этот период. В плане ставилась задача увеличить производство военной техники на 26% против довоенного плана на этот период. В области капитального строительства финансовые, материально-технические и трудовые ресурсы концентрировались на важнейших оборонных объектах, главным образом в районах Поволжья, Урала и Сибири. Предусматривалась частичная или полная консервация второстепенных строек. В утвержденный список ударных строек вошли военные предприятия, электростанции, предприятия металлургической, химической и топливной промышленности, стройки железных дорог. Основные ресурсы перераспределялись в пользу военной промышленности и кооперированных с нею отраслей. Однако в целом объем работ по капитальному строительству снизился по сравнению с довоенным периодом в связи с тем, что часть материальных ресурсов, главным образом металл, была направлена на удовлетворение нужд военного производства. Довоенный уровень железнодорожных перевозок сохранялся только по перевозкам угля, нефтепродуктов, металла и зерна. С целью экономии товарных ресурсов план розничного товарооборота был снижен на 12%.