Вскоре после того как записка З.П. Рожественского легла на стол А.А. Бирилеву, о ней узнали придворные моряки — контр-адмирал К.Д. Нилов, занимавший должность флаг-капитана императора с октября 1905 г., и начальник военно-походной канцелярии ЕИВ капитан 1-го ранга А.Ф. Гейден. Именно они, по мнению историка флота и офицера МПИ М.А. Петрова, убедили Николая II в целесообразности создания МГШ[140]. Должности флаг-капитана императорских яхт и начальника военно-походной канцелярии были во многом представительскими, но они позволяли постоянно общаться с царем. Флаг-капитан был начальником всех императорских яхт, паровых и гребных катеров и шлюпок при загородных дворцах. Он должен был сопровождать царя, когда тот находился на императорской яхте или на другом корабле. Обычно на этот пост назначалось лицо, пользующееся особой симпатией императора. Императорская Главная квартира была важнейшим военно-придворным учреждением дореволюционной России. Ее возглавлял командующий, который заведовал всеми лицами, принадлежащими к составу Главной квартиры, в том числе всеми генерал— и флигель-адъютантами, он отдавал все распоряжения относительно путешествий царя и обеспечивал его безопасность. В состав Главной квартиры входили собственный его величества конвой, канцелярия дежурного генерала, заведовавшего дворцовой полицией и военно-походная канцелярия ЕИВ, которая до 1904 г. именовалась просто канцелярией императорской Главной квартиры. Она постоянно следовала за императором во время его путешествий.

19 февраля 1906 г. наиболее авторитетным в глазах А.А. Бирилева адмиралам было разослано письмо морского министра с просьбой высказать свои предложения по реорганизации ведомства. В ответ на него были получены весной-летом 1906 г. записки от бывшего наместника на Дальнем Востоке Е.И. Алексеева[141], бывшего управляющего Морским министерством Ф.К. Авелана[142] и состоящего при особе царя вице-адмирала H.H. Ломена[143]. Характерно, что во всех трех записках предлагалось вновь объединить ГМШ и МГШ, однако разными способами. Если Ф.К. Авелан и H.H. Ломен фактически призывали вернуться к довоенным порядкам, то Е.И. Алексеев предлагал упразднить ГМШ, переименовав при этом МГШ в Морской штаб; ту же точку зрения впоследствии отстаивали офицеры МГШ. Вместе с тем Е.И. Алексеев выступил против объединения технической и хозяйственной частей как в центре, так и на местах. Непонимание высшими морскими чинами роли штаба хорошо иллюстрирует замечание H.H. Ломена о том, что план войны должен разрабатывать главнокомандующий, а вовсе не МГШ. В записках Е.И. Алексеева и H.H. Ломена, кроме того, предлагалось передать ГГУ, УГМИФ и Канцелярию Морского министерства в непосредственное подчинение министра, а не его товарища. H.H. Ломен разработал и собственную схему управления Морским министерством[144]. Наиболее оригинальной чертой его проекта было введение МГШ в подчинение ГМШ и появление поста инспектора стрельбы во флоте, подчиненного ГМШ. В хозяйственно-технической сфере предусматриваемые схемой изменения были невелики и ограничивались заменой Инспекций МТК отделами по специальностям, во главе с начальником судостроения. При этом предусматривался Счетный отдел, напрямую подчиненный товарищу морского министра, который должен был играть роль ГУКИС. Все эти пожелания шли вразрез с только что проведенным образованием МГШ, поэтому не имели шансов на осуществление.

В эти месяцы многие руководители подразделений министерства стремились улучшить положение своего учреждения и повысить его внутриведомственный вес, а заодно и облегчить свою работу. Так, директор Канцелярии Морского министерства тайный советник Е.Е. Стеблин-Каменский предложил свой вариант «Положения об управлении морским ведомством»[145]. Сохранившийся экземпляр проекта не подписан, но на автора указывает то обстоятельство, что устройство Канцелярии Морского министерства согласно данному проекту очень близко к организации Управления по законодательным делам морского ведомства, создать которое предлагал Е.Е. Стеблин-Каменский позднее, в 1910 г. Наиболее интересная черта этого проекта — объединение в Канцелярии Морского министерства Законодательной и Сметной частей из ГМШ и ГУ КИС. Это объединение привело бы к серьезному увеличению внутриведомственного веса Канцелярии. Что касается других учреждений Морского министерства, то предусматривалось создание Главного кораблестроительного управления и Главного управления портов. Этот проект отчасти предвосхищает будущую организацию морского ведомства, введенную в октябре 1911 г. Главное управление портов должно было отвечать за снабжение флота расходными материалами, топливом, продовольствием, за постройку береговых сооружений, судоремонт и ведать наймом и увольнением вольнонаемных служащих и рабочих. По своим функциям оно напоминало будущее Главное морское хозяйственное управление. Местными органами этого учреждения должны были стать портовые управления. К Главному кораблестроительному управлению Е.Е. Стеблин-Каменский предполагал передать все судостроение как в научно-техническом, так и в хозяйственном отношении. Этот проект, как и многие другие, остался на бумаге.

На основе Стратегической части ВМУО ГМШ 6 апреля 1906 г. был создан МГШ. 6 июня последовал высочайший указ Правительствующему Сенату, гласивший, что разработка всех мероприятий по организации морских сил возлагалась на МГШ[146]. Циркуляром начальника ГМШ контр-адмирала А.А. Вирениуса 28 апреля 1906 г. в распоряжение капитана 1-го ранга Л.А. Брусилова, назначенного начальником нового учреждения, были выделены 14 офицеров, которые и составили костяк МГШ. Это были капитаны 2-го ранга М.И. Каськов 1-й, Л.Б. Кербер, М.М. Римский-Корсаков 3-й, барон О.О. Рихтер, А.В. Шталь, лейтенанты П.П. Владиславлев, Б.И. Доливо-Добровольский, М.И. Дунин-Барковский, А.В. Колчак, Л.Г. Постриганев, М.И. Смирнов 3-й, барон И.А. Черкасов, А.Н. Щеглов и штабс-капитан В.М. Вавилов[147].

Самым старшим в МГШ не только по положению, но и по возрасту был сорокадевятилетний Л.А. Брусилов, о котором говорилось выше (см. с. 28). Он оставался начальником МГШ до июня 1908 г., когда вынужден был уйти со своего поста и вскоре вышел в отставку.

Исполняющим обязанности помощника начальника штаба и заведующим 1-м (оперативным) отделением стал А.В. Шталь (1865–1950), уже 20 лет служивший на флоте в офицерских чинах. В 1890 г. он закончил Николаевскую Морскую академию по гидрографической специальности, а в 1903–1904 гг. прослушал там же курс военно-морских наук — морской аналог сухопутной Николаевской Академии Генерального штаба. Еще в 1904 г. А.В. Шталь пришел во ВМУО ГМШ. Впоследствии А.В. Шталь стал генерал-майором по Адмиралтейству, помощником начальника НМА, но на кораблях не служил, поскольку с ноября 1907 г. был зачислен в береговой состав. К моменту назначения в МГШ он участвовал в боевых действиях в Китае во время подавления «боксерского» восстания, будучи офицером эскадренного броненосца «Полтава». После Октября 1917 г. вступил в РККФ, работал в Военно-морской академии и написал ряд работ, в частности «Служба штаба Морских Сил», изданную в 1928 г. К моменту отставки в 1947 г. А.В.Шталь стал вице-адмиралом, скончался в Ленинграде.

В подчинении А.В. Шталя оказался Митрофан Иванович Каськов (1867–1917), отвечавший за создание плана войны на Черноморском театре. Вершиной его карьеры стал пост начальника штаба Черноморского флота, который М.И. Каськов занял в июле 1916 г. по инициативе А.В. Колчака который, только что стал командующим Черноморским флотом. С А.В. Колчаком он был хорошо знаком по совместной службе в МГШ. Однако совместная служба двух бывших генштабистов продолжалась недолго, уже в ноябре 1916 г. М.И. Каськов ушел с должности начальника штаба флота, получив чин контр-адмирала. Жизнь его оборвалась трагически — он был расстрелян в Севастополе в ночь с 16 на 17 декабря 1917 г.[148] М.И. Каськов был самым большесемейным офицером МГШ — у него было шестеро детей.