Митрополит Алексей в качестве правителя Московского княжества решил пригласить Бориса на переговоры в Москву. С этой целью в Нижний Новгород были направлены послы архимандрит Павел и игумен Герасим. Борис, естественно, отказался. Тогда послы митрополита закрыли все церкви. Это заставило Бориса хоть как-то действовать. Он послал в Москву в качестве послов бояр. Но на послов Бориса в пути напали военные князя Василия, старшего сына Дмитрия Суздальского. Большинство бояр были захвачены в плен. Только один из них добрался до Москвы. Там он и остался на службе у московского князя. Эти события происходили в 1363 году.
Сам Дмитрий Суздальский не расставался с мечтой получить в княжение великое Владимирское княжество. Он послал своего старшего сына Василия в Орду за ярлыком на княжение во Владимирском княжестве. В 1364 году сарайский хан Азиз со своим послом Улусмондом послал Дмитрию столь желанный для него ярлык. Однако ярлык еще не решал проблемы. Дмитрий-Фома понимал, что московский князь Дмитрий не позволит ему занять Владимирский стол. Взвесив все за и против, а главное то, что у него не было военной силы (он владел только уделом), Дмитрий-Фома решил поторговаться с московский князем. За полученный в Орде ярлык он «испросил и взял себе у него (Дмитрия Московского) силу къ Новгороду къ Нижнему на брата своего князя Бориса». Московский князь, а точнее правивший за него митрополит попытался решить проблему по дипломатическим каналам. Но это не удалось. Тогда он предоставил Дмитрию-Фоме воинские отряды для того, чтобы тот мог решить проблему. Дмитрий Константинович (Дмитрий-Фома) собрал воинские отряды и в своем Суздальском княжестве. Во главе объединенных воинских отрядов он пошел на Нижний Новгород. У его брата Бориса не было сил противостоять наступающим. Поэтому у Бережца вблизи места, где река Клязьма впадает в реку Оку, он в присутствии своих бояр «кланяяся и покаряяся и прося мира, а княжениа ся съступая». Так Борис отдал княжение в Нижнем Новгороде брату Дмитрию. Как видим, всё было решено по-братски. После этого Борису ничего не оставалось, как вернуться домой, в свой Городецкий удел. Дмитрию-Фоме мог мешать и его второй брат Андрей. Но к его радости, тот 2 июня 1365 года скоропостижно скончался. Так Дмитрий Константинович закрепился в Нижнем Новгороде. Однако с этого времени он уяснил себе, что прочность его положения зависит не столько от Орды, сколько от отношения к нему великого князя Московского и Владимирского. На этот раз у Дмитрия Константиновича хватило ума не нарушать те договоренности с Москвой, благодаря которым он занял стол в Нижнем Новгороде. Более того, Дмитрий Константинович Нижегородский породнился с московским князем – князь Дмитрий Московский женился на младшей дочери Дмитрия Константиновича Евдокии. Это произошло в январе 1367 года. Кроме того, свою старшую дочь Марию нижегородский князь Дмитрий Константинович выдал замуж за Николая (Ми-кулу), сына первого из московских бояр тысяцкого В. Вельяминова. Так проблема Нижегородского княжества московским правительством (митрополитом Сергием) была решена блестяще. После этого можно было сосредоточиться на решении проблемы Тверского княжества, которое почти всё время находилось в конфронтации с Московским княжеством.
Надо иметь в виду, что описываемые события происходили в условиях, когда Орда раскололась на части, была занята внутренней борьбой и ослабила контроль над русскими землями.
В Тверском княжестве события развивались так же, как и в других русских княжествах. Основная линия – это борьба между родственниками за княжеский стол. Вторая линия – это защита от внешних угроз. Для Тверского княжества внешние угрозы исходили от Литвы, Великого Новгорода и Москвы. Поэтому в зависимости от обстановки заключались союзы с Литвой против Москвы, с Москвой против Литвы, с Новгородом и т. д. Что касается Орды, то она в этих сценариях занимала особое место: к ней обращались за помощью, бежали в Орду (не с пустыми руками) за ярлыком на княжение, за военной помощью, чтобы взять перевес над братом, дядей, племянником. Как правило, в междоусобных войнах главных фигурантов не убивали и не пытали, но за то неоднократно «воевали» города, села, усадьбы. При этом стремились как можно больше разорить, выжечь, разрушить и изрубить. Рубили простой народ, который ко всему этому вообще был непричастен. Разрушали и выжигали, чтобы устрашить своего родственника-противника. После этого с ним мирились, договаривались. Затем проигрывались новые комбинации и новые осады, разорения, разрушения и выжигания. И все это делалось ради личной власти того или иного князя, ради расширения его владений. Князья дерутся, у мужиков чубы трещат. Так было всегда, только в разных масштабах.
Московский князь потерял Владимирский стол в 1360 году. В Твери в это время правил великий князь Василий Михайлович Кашинский. Ему дышали в затылок его два племянника – сыновья его брата Александра Михайловича Тверского. К этому времени они уже не были новичками в междоусобной политике. Старший из племянников Всеволод в 1348 – 1349 годах уже занимал стол великого княжения Тверского. Однако более изворотливым и цепким оказался младший из них – Михаил Александрович. Он мыслил шире и в своих властолюбивых планах прибегал к политическим интригам за предела ми княжества. Так, в 1362 году он ездил в Литву, что бы заключить договор с литовским князем Ольгердом. До этого «Литва волости Тверские имали». Осенью 1365 года Михаил Александрович уже сидел на Тверском великокняжеском столе. Его дядя Василий Кашинский удалился в свой Кашин. Создалась ситуация, которая способствовала расширению владений Михаила Александровича. Речь идет о моровой эпидемии, которая скосила не только большое число простолюдинов, но и многих местных князей. Их владения остались бесхозными. Так, уже в 1366 году князь Михаил Александрович княжил не только в Тверском княжестве. К нему отошел и удел его отца. Кроме того, к нему отошла половина клинских волостей. Их перед своей смертью отписал Михаилу Александровичу их владелец, князь Семен Константинович. Всё это означало, что Тверское княжество стало реальным конкурентом Московского княжества в смысле претензий на Владимирский престол.
Москва была обеспокоена усилением Тверского княжества и с надеждой смотрела на Василия Кашинского и его брата Семена Еремея. Назревал конфликт между двумя дядями и племянником, который сидел на княжеском столе в Твери. Причиной конфликта было то, что Михаил Александрович поставил крепость в уделе дяди Семена Еремея. Власть митрополита Алексея распространялась и на Тверское княжество. Он распорядился, чтобы тверской епископ Василий рассудил враждующих. Но, как и следовало ожидать, епископ занял сторону того, у кого была реальная власть, то есть Михаила Александровича.
В 1367 году тверского епископа митрополит Алексей вызвал в Москву «на ковер». Здесь епископу «бышеть истома и проторъ великъ». Досталось не только епископу Василию, но и самому Михаилу Александровичу, поскольку митрополит (за которым стояла реальная военная сила) обвинил его в захватничестве и оправдал князей Василия и Семена Еремея – его дядей. Михаил Александрович Тверской бежал в Литву, а братья Василий и Семен Еремей «повоевали» тверские волости. Им в поддержку были даны московские полки, которые опустошили тверские и клинские земли на правом берегу реки Волги.
В конце октября 1367 года великий князь Михаил Александрович вернулся из Литвы, прихватив с собой литовскую подмогу. Он с помощью литовского войска восстановил свою власть над Тверским княжеством в полном объеме. Князь Еремей Константинович перешел на службу к московскому князю. Его удел занял Михаил Александрович. Московский князь в принципе мог заступиться за своего подопечного. Однако он делать этого не стал – за спиной у Михаила Александровича была Литва. Поэтому в начале 1368 года московский князь Дмитрий заключил мирный договор с великим князем Тверского княжества Михаилом Александровичем.
Митрополит Алексей продолжал активно работать над укреплением Московского княжества. В определенных ситуациях он подключал и тяжелую артиллерию византийской церкви. Так, в 1370 году он обратился к константинопольскому патриарху Филофею с жалобой на тех князей, которые в борьбе с Москвой поддержали Тверь и Литву. Патриарх Филофей отреагировал на жалобу Алексея оперативно и вскоре издал два интердикта. В одном из них сообщалось, что князь Смоленского княжества Святослав отлучается от православной церкви. В отлучительной грамоте патриарха объяснялась причина отлучения Святослава от церкви. В грамоте было сказано: «Мерность наша узнала, что ты согласился и заключил договор с великим князем всея Руси кир Дмитрием, обязавшись страшными клятвами и целованием честного и животворящего креста в том, чтобы тебе ополчиться на врагов нашей веры и креста, поклоняющихся огню и верующих в него. И великий князь, как условился и договорился с тобою, был готов и ожидал тебя; но ты не только не сделал, как обещался и клялся, но, преступив клятвы, договор, обещание и крестное целование, ополчился вместе с Ольгердом против христиан, и многие из них были убиты и разорены…»