Спустя два месяца контр-адмирал П. А. Чебышёв в связи с угрожающими действиями Англии, имеющей мощный броненосный военный флот, направляется приказом Управления Морского министерства руководить морскими укреплениями Свеаборга. Этот крупный российский военный форт, вооруженный крупнокалиберной артиллерией, закрывал подходы с моря к Петербургу. Именно Свеаборг во время Крымской войны не дал подойти большой англо-французской эскадре к северной столице России.

После Русско-турецкой войны 1877–1878 гг. Англия и Австро-Венгрия, недовольные статьями мирного договора, заключенного в Сан-Стефано 19 февраля 1878 г., стали оказывать на Россию давление. В ходе этой войны, где главные события разворачивались на суше, русский флот, тем не менее, сумел вытеснить с Черного моря турецкие корабли и применил на практике новые средства ведения морского боя — миноносцы. Здесь проявился талант будущего флотоводца и военного инженера Степана Осиповича Макарова, который первые шаги в своей карьере делал под началом Петра Афанасьевича Чебышёва.

Время неумолимо двигалось вперед, военно-морской флот одевался в броню, его вооружение становилось более мощным и сложным. Но России по-прежнему нужны были опытные моряки с боевым опытом. 12 апреля 1881 г. контр-адмирал Чебышёв назначается младшим флагманом Балтийского флота, ровно через год его ждёт новая заграничная командировка: 5 апреля 1882 г. он назначается начальником отряда российских военных судов в Греческих водах.

Это, однако, не означало, что морякам эскадры Чебышёва приходилось нести службу исключительно у берегов Греции, контролируя ее взаимоотношения с вековым противником России — Османской Турцией. Отряду кораблей под командованием контр-адмирала Чебышёва доводилось бывать и в водах других государств Средиземноморья.

В мае 1884 г. Пётр Афанасьевич по приказу Управления Морского министерства сдает командование отрядом и направляется в Россию. По воспоминаниям его правнучки Татьяны Александровны Аксаковой, проживавшей в Ленинграде, жители Неаполя подарили уже старому адмиралу небольшой круглый столик, в доске которого перламутровой инкрустацией были изображены все 11 кораблей, на которых он служил и которыми командовал в разное время.

13 апреля 1886 г. в возрасте 66 лет Пётр Афанасьевич был произведен в вице-адмиралы. Это был его последний чин. Он уезжает на родную калужскую землю, где находилось его родовое имение. В сельце Аладино он занимается хозяйством, его новое любимое дело — разведение яблоневых садов. Заслуги старого боевого флотоводца не были забыты государством: в 1890 г. в связи с 50-летием его службы на флоте Пётр Афанасьевич получает еще одну награду — орден святого Владимира.

Умер вице-адмирал Чебышёв 29 января 1891 г. в родном Аладино. Как гласит его послужной список, всей службы — 54 года, с прибавкой за военное время — 62 года. 9 апреля 1891 г. вдова вице-адмирала Юлия Григорьевна Чебышёва обратилась с прошением в Управление Морского министерства о назначении ей в связи со смертью мужа пособия и пенсии. Просьба была удовлетворена.

Славные боевые традиции семьи Чебышёвых продолжил внук Петра Афанасьевича, тоже морской офицер, герой Русско-японской войны, Андрей Петрович Штер (1878–1907). Прах его покоится в одной могиле с прахом деда на кладбище села Субботники Сухиничского района.

За свою недолгую жизнь он тоже сумел оставить своё имя в славной истории Военно-морского флота России. Послужной список лейтенанта Андрея Петровича Штера гласит:

«Родился в С-Петербурге 7 октября 1878 г. Из потомственных дворян. Поступил в Морской корпус 30 августа 1891 г., а 15 сентября 1897 г. по окончании корпуса произведен в мичмана и зачислен в Сибирский флотский экипаж…».

После — служба на брандвахтенной лодке «Горностай» во Владивостоке, на пароходе-ледоколе «Надежный», транспортах «Тунгуз», «Ермак», «Алеут», канонерской лодке «Манджур», крейсерах «Князь Пожарский», «Джигит», «Россия». И, наконец, служба с декабря 1903 по август 1904 г. вахтенным начальником на крейсере 2-го ранга «Новик», где капитанами были последовательно Н. О. фон Эссен и М. Ф. фон Шульц.

23 января 1904 г. Япония объявила России войну. Весь годный для боевых действий флот Японии был объединен под начало опытного вице-адмирала Того Хейхачиро. Как известно, японский военный флот застиг нашу Тихоокеанскую эскадру врасплох. Она была разделена на две части. Меньшая часть эскадры осталась во Владивостоке, большая, состоявшая из 7 линейных кораблей, 5 лёгких крейсеров (среди них «Новик»), 5 канонерских лодок и 25 миноносцев, находилась на рейде Порт-Артура. Именно эта российская эскадра и была атакована ночью 24 января 1904 г. японскими миноносцами.

Прибытие в Порт-Артур адмирала С. О. Макарова, сменившего вице-адмирала О. В. Старка, было воспринято моряками-тихоокеанцами с радостью. В течение всего одного месяца (столько было отпущено адмиралу судьбой) было сделано немало для укрепления крепости Порт-Артура и эскадры. Но 31 марта 1904 г. флагман «Петропавловск», взорвавшись на минах, в считанные минуты затонул. Вместе с главнокомандующим флотом погибло около 600 человек офицеров и матросов. Стратега, равного адмиралу Макарову, найти было невозможно, но трагедия сплотила лучших морских офицеров эскадры.

Среди русских кораблей, отличавшихся своими высокими боевыми качествами, крейсер «Новик», на котором служил внук адмирала Чебышёва Андрей Петрович Штер, успешно отбивал атаки японских миноносцев и других кораблей противника, стремившихся «закупорить» русские корабли в заливе.

Именно капитан 2-го ранга Н. О. фон Эссен, командовавший с декабря 1902 г. по март 1904 г. крейсером «Новик», предлагал решительные действия для прорыва русской эскадры во Владивосток, но заменивший адмирала Макарова адмирал В. К. Витгефт проявил нерешительность, чем позволил японцам создать внушительное преимущество на море. Результатом стало поражение ослабленной Тихоокеанской флотилии у мыса Шантунг.

Пробившись сквозь огневые заслоны вражеских кораблей, крейсер «Новик» под командованием капитана 2-го ранга Шульца взял курс на Владивосток. Недостаток угля заставил его зайти в порт Корсаковский, где и произошло последнее сражение «Новика». Первый бой с японским крейсером «Цусима» был успешным. Японский корабль был настолько поврежден после артиллерийской дуэли, что с трудом ретировался. Но появившийся второй японский крейсер не давал шансов на победу, поскольку «Новик» тоже получил серьезные повреждения и вырабатывал последние запасы угля. В этом бою лейтенант А. П. Штер был ранен.

В своем рапорте капитан крейсера «Новик» М. Ф. фон Шульц давал следующие сведения:

«…B 4 ч. дня снялся с якоря и пошел навстречу неприятельскому судну. Выйдя с рейда, повернул на W, чтобы этим ввести в заблуждение противника и потом с наступлением темноты повернуть на обратный курс в Лаперузов пролив… В 5 ч. 15 мин., сойдясь с противником до 40 каб., открыл по нем стрельбу, на что тотчас же последовал ответный огонь. Сам я получил снаряд в корму. Этим снарядом убило комендора ютовой 120-мм пушки Аникина, ранило лейтенанта Штера и прислугу. Лейтенант Штер, перевязавшись тут же, на палубе, остался управлять кормовым плутонгом…».

Ночью подошли к крейсеру русские баржи, которые и перевезли на берег всю команду. Сам крейсер «Новик» был затоплен недалеко от берега на глубине 28 футов.

Вскоре после окончания войны Андрею Петровичу Штеру предстояло освоить совершенно новое для себя дело, которое поручалось лишь самым лучшим офицерам: создавать боевые экипажи первых российских подводных лодок. С марта по май 1905 г. он был помощником командира подводной лодки «Дельфин» лейтенанта Г. С. Завойко, а потом стал поочередно командиром подводных лодок «Форель» и «Сом». В связи с началом Русско-японской войны, к концу лета 1905 г., с Балтики во Владивосток было транспортировано по железной дороге 13 подводных лодок.