В мае 1944 года подводная лодка «I-45» получила приказ выйти на поиск противника к востоку от Маршалловых о-вов. Выполняя приказ, лодка на полной скорости прошла пролив Бунго и направилась к указанному ей району.
Однажды утром, когда лодка шла в надводном положении, отдыхавший внизу командир лодки услышал команду вахтенного офицера: «Срочное погружение!» Вслед за этим лодка подверглась нападению вражеского самолета, вынырнувшего из-за облаков. Не успев погрузиться, лодка получила прямое попадание в корму. Взрывом приподняло всю лодку, ее носовая часть находилась на поверхности. Противник открыл огонь из пулеметов. Решив спасти лодку, командир попытался медленно уйти под воду, дав задний ход. Это удалось, лодка начала медленно погружаться, имея дифферент в 7?. Глубина погружения достигла 138 м. На этой глубине под давлением воды вогнулись листы прочного корпуса кормовой части лодки. Для того чтобы приостановить дальнейшее погружение, был отдан приказ продуть цистерну глав ного балласта. Однако при продувании пузыри воздуха достигли поверхности воды и были замечены противником, который не замедлил повторить атаку. К счастью, команде удалось удержать лодку на глубине 92 м, на которой она и находилась затем весь день до захода солнца. Под покровом темноты лодка всплыла, чтобы определить характер повреждений. В кормовой части имелась большая пробоина, пришлось направиться для ремонта в Йокосука. Переход сначала протекал без приключений, однако в Токийской бухте в самой гуще противолодочных сетей вышло из строя рулевое управление. После некоторых усилий лодке удалось выбраться и благополучно дойти до Йокосука. Осмотр в сухом доке показал, что у лодки осталось лишь одно перо вертикального руля, остальные рули были потеряны, лодке просто посчастливилось в таком состоянии дойти до базы.
Еще до того как противник произвел высадку на о. Сайпан, делались различные догадки о месте предстоящей высадки, однако разведка не сумела дать командованию надежную информацию по этому вопросу. Высадка противника на о. Сайпан была произведена 15 июня 1944 года. Подводные лодки получили приказ сосредоточиться в районе о. Сайпан, но занять позиции для атаки они не успели. Во второй половине мая 1944 года 8 подводных лодок («Ro-104», «Ro-105», «Ro-106», «Ro-108», «Ro-109», «Ro-112», «Ro-116» и «I-44») заняли позиции в 150 милях к северу от о-вов Адмиралтейства. Им была поставлена задача нанести удар по американским силам, следовавшим вдоль побережья Новой Гвинеи к о-вам Биак и Палау. Противник уже хорошо отработал тактику борьбы с нашими подводными лодками. Обнаружив одну лодку, он начинал поиск в этом районе и других, заставляя их все время находиться под водой. В данном случае одна из наших лодок была обнаружена по прибытии в район, назначенный ей для патрулирования. В результате и все остальные лодки по прибытии на свои позиции также подверглись атакам самолетов и кораблей противника. Подводную лодку «Ro-109» они бомбили целый день. В это время из штаба подводных сил была получена информация о том, что противник полностью осведомлен о дислокации всех наших подводных лодок, принимавших участие в этой операции. Лодки «Ro-109» и «Ro-108», действуя самостоятельно, немедленно изменили курс и заняли позиции, находящиеся на несколько сот миль в стороне от названного района. В результате этого им удалось спастись. Остальные пять лодок типа «Ro» были потоплены.
Подводная лодка «I-44», которая первая получила на вооружение радиолокационную аппаратуру, уцелела. Ей было приказано выйти к северу от о-вов Адмиралтейства. Покинув Куре 15 мая, она направилась на позицию. Следуя ночью в надводном положении, лодка неожиданно подверглась нападению вражеской авиации. Вахтенный офицер отдал приказ произвести срочное погружение. Когда несколько позднее лодка всплыла, опять появились самолеты и начали бомбить лодку. Радиолокационная станция лодки работала скверно, поэтому лодке пришлось снова погрузиться и оставаться в подводном положении. Ночью, когда в лодке все спали, неожиданно последовала серия взрывов глубинных бомб, в результате которых был выведен из строя глубиномер и почти во всех отсеках появилась вода. К 11 час. запаса энергии батарей осталось всего на один час хода. Старший помощник, будучи очень храбрым офицером, предложил всплыть и принять бой, так как дальнейшее пребывание под водой с разряженными батареями становилось не менее опасным. Командир лодки согласился с его доводами и приказал приготовиться к артиллерийскому бою, а также приготовить пулеметы и револьверы. Наблюдение в перископ показало, что в воздухе находится летающая лодка, а невдалеке ожидал свою жертву эскадренный миноносец. В этот момент неожиданно налетел шквал. Эту возможность нельзя было упустить, поэтому лодка всплыла и, оставив за кормой эскадренный миноносец, на полной скорости начала уходить на северо-запад. Около часа спустя в пределах видимости появилась четырехмоторная летающая лодка. Однако она пролетела стороной, не атаковав подводную лодку. Приближаясь к о. Сайпан, лодка сделала попытку погрузиться, однако клапаны вентиляции не сработали, и ей пришлось открыть распределительный клапан низкого давления. Таким образом, лодка была спасена и имела возможность сражаться в последующие дни.
Когда противник высадился на о. Сайпан, в этот район были направлены все имевшиеся в наличии подводные лодки, в том числе и лодка «Ro-115», которая до этого патрулировала в районе Палау. К 19 июня лодка достигла позиции в 50 милях к западу от о. Рота, она шла в надводном положении в водах, хорошо контролируемых авиацией противника. Неожиданно ее атаковали самолеты. Одна из бомб разорвалась всего в 40 м от лодки, однако не причинила повреждений, и лодка продолжала следовать дальше. Затем появилось довольно крупное подразделение сил противника, и ей пришлось вновь уйти под воду.
В течение продолжительного времени подводная лодка «Ro-115» пыталась обнаружить соединение вражеских авианосцев и наконец ей это удалось. После захода солнца подводная лодка проникла через охранение эскадренных миноносцев и выпустила по авианосцу типа «Уосп» четыре торпеды. Результаты атаки наблюдать не удалось, так как лодка немедленно погрузилась. К несчастью, ей не удалось избежать атаки. В результате взрывов глубинных бомб в лодке образовалась течь и половина освещения была выведена из строя. Но в последующем ничего худшего не случилось. Израсходовав весь имевшийся запас торпед, лодка возвратилась в Трук. К этому времени туда уже прибыли подводные лодки «Ro-113», «Ro-114», «Ro-109» и «I-5».
Когда американцы развернули наступление на о. Гуам, подводной лодке «Ro-114» было приказано обогнуть остров и атаковать корабли противника. Но после того как лодка донесла, что ею торпедирован большой корабль противника, о ней не поступало больше никаких известий.
Подводные лодки «I-26», «I-45» и «I-55» вышли из Йокосука к Гуаму, имея на борту танки, пушки и боеприпасы. Однако до острова удалось дойти лишь одной «I-26». О подводной лодке «I-55» после выхода ее из Йокосука не поступило никаких известий, а лодка «I-45» вернулась в Йокосука после того, как крепление, державшее танк, ослабло, и он был смыт в море. Подводной лодке «I-26» удалось доставить танк на о. Гуам, блокированный противником. Достигнув места выгрузки, лодка, идя подводным ходом, коснулась грунта, а затем застряла в нем, казалось, намертво. Командир приказал штурману уточнить место. Штурман доложил, что на юго-западе острова имеется мель, на которую, вероятно, они и сели. Дождавшись захода солнца, на лодке запустили двигатели, дали задний ход, и после некоторых усилий она снялась с мели и достигла перископной глубины.
Осмотр показал, что лодка фактически села на мель в самом месте выгрузки. Выполнив свою задачу, подводная лодка «I-26» проскочила вражеские кордоны и возвратилась в Йокосука.
В период боев за остров Сайпан было потеряно 13 подводных лодок: «Ro-36», «Ro-42», «Ro-44», «Ro-48», «Ro-111», «Ro-114», «Ro-117», «I-5», «I-6», «I-10», «I-55», «I-184» и «I-185». Остальные лодки — «I-26», «I-38», «I-41», «I-44», «I-45», «Ro-109», «Ro-112», «Ro-113» и «Ro-115» благополучно возвратились в базу. В боях за Сайпан подводные лодки начали впервые действовать, имея на вооружении радиолокационную аппаратуру; из лодок, имевших на вооружении радиолокационные установки, лишь 1/3 получила повреждения, в то время как 2/3 лодок, не имевших таких установок, погибли. Это наглядно иллюстрирует огромное значение радиолокации.