В его отсутствие в Македонии началось восстание во главе с Птолемеем I Алоритом, возможно, сына Аминты II Малого (который недолго был царем в 393 до н. э.). Он женился на Эвриное, сестре Александра. Птолемей, по-видимому, не претендовал на трон, но он был близким советником Аминты III в 370-х гг. до н. э., обладал опытом в ведении дел и был одним из тех, кто мог считаться кандидатом на царствование. В Фессалии фиванский полководец Пелопид вытеснил македонские войска из оккупированных ими городов, а затем двинулся в Македонию, где стал арбитром во внутреннем конфликте. Он примирил Птолемея с царем, а Александр стал союзником Фив. Но в качестве залога своего хорошего поведения Александру пришлось предоставить Фивам заложников. И Птолемей все еще находился поблизости. Александр был унижен и оскорблен. «Урегулирование» проблемы с Пелопидом гарантировало множество трудностей, причем надолго.[44]

Учитывая предшествующую историю царства, последующие события неудивительны. Вытесненный из Фессалии Александр находился в трудном положении и был унижен той легкостью, с которой он был поставлен на место Пелопидом. Птолемея I поддерживала вдова Аминты Эвридика, по мнению некоторых современников, находившаяся с ним в интимных отношениях. Весной 367 г. до н. э. Птолемей организовал убийство своего зятя Александра.[45] Такое развитие событий было очень вероятно еще с того времени, как он «примирился» с Александром после восстания за год до этого, но ему было позволено жить в царстве. Птолемей при поддержке Эвридики захватил власть. Фиванцы, которые были в союзе с Александром и выступили посредниками при примирении, не отреагировали.

Формально Птолемей было опекуном следующего сына Аминты, Пердикки III, и в течение следующих трех лет монеты чеканились от имени Пердикки.[46] Именно к Птолемею за принятием решений обращались иностранные представители, хотя мы не имеем информации о степени его власти над «товарищами»-аристократами — она была, возможно, еще меньше, чем у Аминты и Александра. Пердикка был, вероятно, всего на год или около того моложе своего погибшего брата. Когда самый младший из трех сыновей Аминты и Эвридики Филипп был в 368 г. до н. э. послан к фиванцам в качестве одного из заложников Пелопида, ему было 13 или 14 лет, значит, в 367 г. до н. э. Пердикке было около 16. Молодость Александра показала, что требуется более зрелый человек. По-видимому, Птолемей и Эвридика считали, что он как раз подходящий для этого кандидат. Соблазн избавиться от Пердикки и самому захватить царский трон должен был быть силен.

Если Птолемей смог подняться к власти с помощью нескольких местных сторонников и иностранной державы, значит, могли и другие. Претендент по имени Павсаний, возможно, младший сын царя Архелая и брат бывшего царя Аргея, двинулся со стороны Халкидики, предположительно получив поддержку от никуда не исчезнувшего Халкидского союза. Он набрал греческих наемников и захватил власть над районом Антем в северо-западной части Халкидики и несколькими небольшими близлежащими городами. Это дало ему удобную базу, возможно с центром в его собственных владениях (исходной базой Птолемея были его владения в Алоре). Птолемей был недостаточно силен, чтобы самому справиться с этой угрозой. Служившие у Павсания воины из Греции и из городов и селений под его контролем, по-видимому, давали ему преимущество. Поэтому Птолемей связался с афинским полководцем Ификратом, который находился в близлежащих водах с небольшим флотом, пытаясь добиться для Афин контроля над давно потерянной колонией — городом Амфиполем. Ификрат смог с легкостью отбросить Павсания, еще раз продемонстрировав таким образом слабость Птолемея.[47]

Через некоторое время Пелопид из Фив по просьбе некоторых македонцев, сторонников Александра, повел войска на север. Но они оказались разочарованы результатом: Птолемей лишь утвердился в своем положении. Это было унижение, но оно определенно удержало его соперников от восстания. Пелопид ушел с еще одной группой заложников, включая собственного сына Птолемея Филоксена. Цель фиванцев, совершенно очевидно, заключалась в том, чтобы обеспечить продолжение внутренних распрей в Македонии.[48]

Власть Птолемея уменьшилась до первоначального Македонского царства от северных склонов Олимпа до Альмопии и До долины Аксия на востоке. Восточный регион за Аксием был потерян; как показало выступление Павсания, большая часть Халкидики была враждебна; западные горные царства все стали независимыми или попали в орбиту влияния Иллирии.

Аминта III не смог восстановить контроль над этими царствами, и Линкестида (родина Эвридики) перешла под власть царя Иллирии Бардалиса. Это придвинуло враждебную границу на расстояние 50 км от Пеллы и Эги. Элимея, самое южное из горных государств, находилась в конфликте со своим южным соседом, и Аминта выступил арбитром в споре, что он мог сделать, только если оба эти государства были независимы от его власти.[49] Находившаяся между Элимеей и Линкестидой Орестида также, без сомнения, была вне досягаемости Аминты, хотя царь Дерда и был союзником Аминты в Халкидской войне. Весь запад находился под властью обширного царства, образованного Бардалисом еще при прошлом поколении.

В 365 г. до н. э. Птолемей был убит, как это случилось и с Александром II. Его убийцей стал его собственный подопечный Пердикка III, который тем самым показал, что уже достаточно вырос.[50] Пердикка был четвертым правителем за пять лет. Проблемы царства — убийства в царской семье, интервенция иностранных войск, внутренние восстания — вновь подчеркнули его слабость. Основной проблемой все еще оставалась структурная слабость царства, которая оставляла персону царя уязвимой, а военную мощь царства минимальной. Пердикка, хотя и столь же юный, каким был его брат Александр во время прихода к власти, был менее безрассуден, но ведь он был свидетелем неурядиц последних пяти лет, что сделало бы осторожным любого. То, как он организовал убийство Птолемея, по крайней мере, показывало его решительность.

В разраставшемся конфликте между Фивами и Афинами Пердикка выбрал Фивы, и в Македонию возвратились некоторые из заложников, которые были взяты, чтобы контролировать Птолемея. В их числе был и младший брат Пердикки Филипп, которому в то время было 16 или 17 лет. Союз Фив с Македонией был частью фиванской «программы» развития военно-морских сил, чтобы противостоять Афинам, но в этот момент они были еще недостаточно эффективны.[51]

Афинский полководец Тимофей двинулся на север с основными силами своего флота, чтобы противостоять этой угрозе. Он захватил контроль над городами Пидна и Метона на побережье Македонии и Потидеей в Халкидике, установив таким образом контроль над большей частью приморской Македонии. Это не давало возможности строить корабли для Фив. Он вступил в дипломатические отношения с фракийцами и правителем Пелагонии на востоке и севере Македонии.[52] Царство Пердикки было таким образом фактически окружено афинянами и их союзниками, в то же время смерть Пелопида в 364 г. до н. э. устранила единственного фиванского политика, который серьезно интересовался севером. Нейтрализовав таким образом Македонию, Тимофей взялся за свои основные обязанности, которые заключались в осаде города Амфиполя. Все это убедило Пердикку подчиниться изменениям в политике, и он присоединился к осаде, которую вел Тимофей.[53]Этот политический курс вскоре также был изменен.