Прокариоты — одна из двух основных групп организмов на Земле (противопоставляются эукариотам), включающая бактерий и сине-зеленых водорослей. У них нет ядра и заключённых в мембраны органелл типа митохондрий; есть теория, что митохондрии и подобные органеллы в эукариотических клетках изначально были симбиотическими прокариотическими клетками.

Пропагула — любая репродуктивная частица. Слово используется при обсуждении процесса воспроизводства, когда мы хотим не конкретизировать конкретный вид воспроизводства, о котором мы говорим — о половом или бесполом, о гаметах или спорах, и т. д.

r-отбор — отбор в пользу качеств, помогающих преуспеть в нестабильной, непредсказуемой обстановке, когда в почёте способность размножаться быстро и своевременно, а адаптированность даёт мало выгод в конкуренции. Полагают, что r — отбор одобряет такие особенности, как высокую плодовитость, небольшие размеры и приспособленность к распространению на значительные расстояния. Примерами являются сорняки и их эквиваленты в животном мире. Противопоставляется K — Отбору. Принято подчёркивать, что r — отбор и K — Отбор — это крайности континуума, большинство реальных ситуаций располагаются между этими полюсами. Экологи забавляются любопытными отношениями любви и ненависти в свете r и K концепцией, часто притворно не одобряют r — отбор, хотя и находят его неизбежным.

Рецессивность — антипод доминантности.

Рекон — минимальная единица рекомбинации. Одно из нескольких определений гена — но, как и мутон, он ещё не заработал достаточно авторитета, чтобы его можно было употреблять без пояснений.

Репликатор — любая сущность во вселенной, с которой сделаны копии. Глава 5 содержит расширенное обсуждение репликаторов и классификацию на активный-пассивный и зародышевый-смертный.

Репродуктивная ценность — демографический технический термин, количество ожидаемых от особи будущих потомков женского пола.

Нарушитель расщепления — ген, фенотипический эффект которого влияет на мейоз таким образом, что этот ген получает более чем 50 % шансов оказаться в успешной гамете. См. также мейотический драйв[46].

Эгоизм — см. альтруизм.

Половая хромосома — специальная хромосома, роль которой заключается в формировании пола. У млекопитающих имеются две половых хромосомы, обозначаемые X и Y. Самцы имеют генотип XY, самки XX. Поэтому все яйцеклетки содержат только X хромосому, а сперматозоид может содержать или X (когда сперматозоид породит дочь) или Y (в этом случае сперматозоид породит сына). Мужской пол, таким образом, называют гетерогаметным, женский — гомогаметным. У птиц очень похожая система, за исключением того, что самцы у них гомогаметны (эквивалент XX), а самки — гетерогаметны (эквивалент XY). Гены, несомые половыми хромосомами, называют "сцепленными с полом", что иногда смешивается с "поло-ограниченными енами", что означает — имеют проявление у того или другого пола (не обязательно на половых хромосомах).

Соматический — буквально — телесный. В биологии термин используется для обозначения смертной части тела, в противоположность зародышевой линии.

Видообразование — процесс эволюционного расхождения одного предкового вида на два новых.

Отбор видов — теория, полагающая, что некие эволюционные изменения происходят посредством разных форм естественного отбора на уровне видов или линий. Если виды, обладающие определёнными качествами, более склонны вымирать, чем виды с другими качествами, то будут иметь место крупномасштабные эволюционные тенденции в направлении одобрения качеств, носимых выживающими видами. В теории — качества, одобренные на уровне видов, могут не иметь отношения к качествам, которые одобрены отбором внутри вида. В главе 6 доказывается, что, хотя отбор видов может объяснять некоторые простые крупные тенденции, он не может объяснить эволюцию сложных адаптаций (см. часы Пали, и макроэволюцию). Теория отбора видов в этом смысле происходит от другой исторической традиции — теории группового отбора альтруистических черт; и обе они рассмотрены в главе 6.

Стазис — в эволюционной теории — период, в течение которого не происходит никаких эволюционных изменений. См. также градуализм.

Стратегия — подобно «альтруизму», используемому этологами в особом смысле, «стратегия» почти что "с точностью до наоборот" связана с бытовым пониманием этого слова. Этот термин был взят из теории игр и использован в биологической теории эволюционно стабильных стратегий, где по существу синонимичен с «программой» в компьютерном смысле, и означает предопредёленное правило, которому повинуется животное. Это значение чётко, но к сожалению, слово «стратегия» стала затасканной жертвой злоупотребления, и ныне окружено ореолом модного синонима для "поведенческого паттерна". Особи в популяции могут следовать стратегии "если мало — бежать, если много — нападать"; наблюдатель при этом видел бы два поведенческих паттерна — убегание и нападение, но он был бы не прав, если бы назвал это двумя стратегиями — это два поведенческих паттерна одной условной стратегии.

Ценность для выживания — степень одобренности данной характеристики естественным отбором.

Симбиоз — близкое взаимозависимое проживание особей разных видов. Некоторые современные учебники опускают условие взаимозависимости, и в понятие симбиоза включают и паразитизм (в паразитизме только одна сторона — паразит — зависит от другой — хозяина, — которому было бы лучше в одиночестве). Эти учебники используют мутуализм вместо симбиоза, как он определён выше.

Симфилическая субстанция — химическое вещество, используемое паразитами социальных колониальных насекомых (например, жуками) для влияния на поведение их хозяев.

Теленомия — наука об адаптации. На деле, теленомия — это телеология, которую Дарвин сделал респектабельной, но поколения биологов были приучены избегать «телеологии», словно это некорректная конструкция в латинской грамматике, и много приятнее иметь дело с эвфемизмом. Будущему содержимому науки теленомии посвящено не очень много размышлений, но некоторые главные заботы — это, возможно, вопросы о единицах отбора и об издержках и других ограничениях на совершенствование. Эта книга — эссе в рамках теленомии.

Тетраплоид — наличие четырех хромосом каждого типа в противовес более обычным двум (диплоид) или одной (гаплоид). Новые виды растений иногда формируются в тетраплоидные посредством удвоения хромосом, но впоследствии вид ведёт себя подобно обычному диплоидному, у которого случилось удвоение набора хромосом относительно близкого вида; его удобно рассматривать как диплоидный в большинстве случаев. Глава 11 предлагает взгляд на гнездо термитов, как расширенный фенотипический продукт с тетраплоидным генотипом, хотя отдельные особи термитов — диплоидные.

Носитель — используется в этой книге в отношении любого сколько-то обособленного объекта, такого, как отдельный организм, который носит в себе репликаторы, и который можно рассматривать как механизм, запрограммированный на сохранение и размножение переносимых им репликаторов в течение цикла его жизни.

Вейсманизм — доктрина, подчёркивающая отличие между бессмертной зародышевой линией и серией смертных тел, содержащих первые. В частности, эта доктрина о том, что зародышевая линия может влиять на форму тела, но никак не наоборот. См. также центральную догму.

Зигота — клетка, являющаяся непосредственным продуктом полового слияния двух гамет.

Апомиксис — потенциально неограниченное размножение живых организмов посредством неоплодотворённых одноклеточных пропагул. См. также партеногенез.

Паттерн поведенческий — некий более-менее шаблонный комплекс действий, направленный (по крайней мере — по идее) на решение какой-то функциональной задачи.