На крейсерах типа “Шарнхорст” между промежуточной и батарейной палубами водонепроницаемые поперечные переборки проходили на -2, 6,17 1/2,24 1/2 (цитадель), 31 1/2,41, 49, 57, 65, 82 – 88 1/2 (цитадель), 73, 76, 95,101 и 109-м шп.; но 41, 57, 73 и 76-й шп. были водонепроницаемы только внутри угольных ям над броневой палубой; на батарейной на 6,42, 50, 62, 70,102 и 110-м шп.; на верхней на 23,31 1/2,46,54,58,60 и 102-м шп. На “Блюхере” между промежуточной и батарейной палубами: на – 2,9,36 1/2,47,90,113 и 123-м шп. и совпадали с передней и задней стенками цитадели.
Всё внутреннее пространство корпуса от внутреннего дна и второго борта до броневой палубы вместе с палубными платформами, шпангоутами и стрингерами делилось проходящими в отдельных местах несколькими продольными водонепроницаемыми переборками на более мелкие водонепроницаемые отсеки, помещения и цистерны.
В числе продольных водонепроницаемых переборок на каждом борту корпуса установили по одной 6-мм коффердамной переборке, идущей вдоль двойного борта по высоте от настила внутреннего дна до скоса броневой палубы на крейсерах типа “Шарнхорст” в районе с 13-го по 90-й шп. и образующий между ней и двойным бортом коффердамы (бортовые проходы или коридоры) длиной 92,4 м, на “Блюхере”, соответственно, с 17-го по 102-й шп. длиной 102 м.
Коффердамы служили камерой расширения при взрывах пробивших броневой пояс снарядов. Максимальное отстояние коффердамных переборок от борта на миделе составляло 2,56 м при ширине коффердама 1,42 м. Эти переборки должны были дополнять назначение бортовой брони по защите внутренних частей корабля от давления газов и действия осколков брони и снарядов, хотя их 6-мм на крейсерах типа “Шарнхорст” или 8-мм на “Блюхере” стенки вряд ли могли служить в качестве противоосколочных переборок.
На крейсерах типа “Шарнхорст” в районе от 13 до 23-го шп. коффердамные переборки располагалась на палубной платформе, с 23 до 79-го шп. в месте прохождения стрингера № 5, с 79 до 93-го шп. на нижней палубной платформе. В районе от 13 до 23-го шп. коффердамы представляли собой одно целое с туннелями боковых гребных валов, в то время как палубная платформа не доходила до двойного борта. Внутри коффердамов на 27,31 1/2, 36,41,45,49, 53, 57,61, 65, 73, 79 и 84-м шп. проходили водонепроницаемые поперечные переборки, делившие их на 15 водонепроницаемых отсеков и цистерн. На каждом борту корпуса на протяжении всех КО в районе с 41-го по 79-й шп. на длине 45,6 м параллельно и на расстоянии 6,8 м от ДП установили переборки продольных расходных угольных ям, проходящие от настила внутреннего дна до броневой палубы.
Водонепроницаемыми поперечными переборками на 49, 57, 65 и 73-м шп. расходные угольные ямы разделили на пять частей. По обоим бортам корпуса между броневой и батарейной палубами в районе с 21-го по 79-й шп. протянулись продольные переборки, расположенные на горизонтальной части броневой палубы, отстоящие на 0,5-1 м от её скосов и образующие внутренний борт верхних угольных ям, расположенных на скосах броневой палубы.
Пересечение шпангоутов, стрингеров, продольных и поперечных водонепроницаемых переборок образовало в двойном дне и внутри каждого из основных отсеков ниже броневой палубы значительное количество отдельных водонепроницаемых помещений различного объема. В число этих помещений на крейсерах типа “Шарнхорст” (“Блюхере”) входили: 62 (75) отсека и цистерн в двойном дне, 30(38) в двойном борту и коффердамах, 32(33) в трюме, 22 (24) на нижней палубной платформе, 21(33) на верхней, 22(26) угольных ямы, 11 переходов, 20 трапов, (два туннеля гребных винтов); всего – 220 (231).
На крейсерах типа “Шарнхорст” под броневой палубой с 31 1/2-го по 78-й шп. по ДП расположили сплошной прямой водонепроницаемый центральный коридор высотой 3 м, шириной 1,45 м и длиной 55,8 м, проходящий без перерыва над всеми КО и передним МО через все водонепроницаемые поперечные переборки, в которых для него проделали проходы. Доступ в него имелся в корме с промежуточной палубы через люк по трапу на 36-м шп. и в передней части через коммуникационную трубу носовой боевой рубки, на “Блюхере” его расположили на верхней палубной платформе с 36 1/2-го по 90-й шп. длиной 64,2 м и по высоте до промежуточной палубы.
Из передней боевой рубки через эту трубу в центральный коридор свободно и легкодоступно проходили система рулевого управления и его указатели, механический телеграф, переговорные трубы, электрические и телефонные кабели, трубопроводы системы воздуха высокого давления (ВВД), противопожарной системы и т.д. В его передней части, расширенной до 4,8 м, разместили центральный пост управления артиллерийским и торпедным оружием.
Толщина стальных стенок центрального коридора составляла 6 мм, настила пола 8 мм. В местах прохода шахт дымовых труб на его обшивку снаружи нанесли слой изоляции для предотвращения нагрева газами дымовых труб. Вентиляция осуществлялась через трубы фок- и грот-мачты.
На “Блюхере” на броневой палубе с 28-го шп. до передней поперечной переборки цитадели на 85-м шп. проходил сплошной прямой водонепроницаемый коридор подачи боеприпасов длиной 68,4 м. Его расположили по ДП между дымоходами труб и шахтами подачи воздуха. Стенки этого коридора частично образовывала обшивка дымоходов и шахт, частично 6-мм стальная обшивка. В промежутках между четырьмя дымовыми трубами имелись расширенные части этого коридора, служившие во время боя местами складирования подаваемых из погребов боеприпасов и с боков в районе расположения шахт подачи воздуха защищённые переборками из 25-мм никелевой стали. От 77-го шп. до передней поперечной переборки цитадели коридор расширили для возможности установки устройств подачи боеприпасов. Доступ в него имелся с броневой палубы через водонепроницаемые двери на 28 и 85-м шп. и с батарейной палубы по двум трапам на 50 и 66-м шп.
По высоте корпус кораблей обоих типов выше КВЛ разделили пятью палубами, часть из которых проходила через весь корабль, ниже КВЛ верхняя и нижняя палубные платформы (твиндек). Под ними установили настил внутреннего (второго) дна, а в носовой и кормовой оконечностях настил трюма.
Снизу вверх располагались: броневая, промежуточная – она же как продолжение броневой в той же плоскости в местах отсутствия бронирования, батарейная, верхняя и надстроечная (спардек) палубы, а поверх них ярусы мостиков.
Из пяти имеющихся на кораблях палуб и двух палубных платформ только верхняя и батарейная были сплошными и проходили через весь корпус. Броневая палуба состояла из трёх частей и также проходили через весь корпус, но на разных уровнях, остальные проходили только в отдельных частях корпуса.
На крейсерах типа “Шарнхорст” глубина трюма составляла 7,22 м, считая от средней части броневой (промежуточной) палубы, и 6,22 м от КВЛ. На 2,6 м выше настила внутреннего дна и на 3,62 м ниже КВЛ расположили водонепроницаемую 8-мм нижнюю палубную платформу. Она начиналась от ахтерштевня и проходила через I и П-й основные отсеки до 22-го шп., прерывалась в районе МО и всех КО, продолжаясь дальше с 79-го шп. через X – XV-й основные отсеки до форштевня. На 2,15м выше нижней палубной платформы и на 1,47 м ниже КВЛ расположили более короткую 8-мм водонепроницаемую верхнюю палубную платформу. Она проходила в районе от 13-го шп. до 22-го шп. во Н-м основном отсеке, прерывалась в районе МО и всех КО, продолжаясь дальше с 79-го по 93-й шп. в X-XII-м основных отсеках. На “Блюхере” обе платформы проходили через I и П-й основные отсеки до 26-го шп. и через XI-XIII-й – нижняя с 90-го по 113-й шп., – верхняя с 90-го по 121-й шп.
На крейсерах типа “Шарнхорст” выше верхней палубной платформы и на 1 м выше КВЛ проходил настил плоской промежуточной (средней жилой) палубы, являвшийся продолжением надводной части броневой палубы от ахтерштевня до 13-го шп., от 13 до 93-го шп. над скосами броневой палубы и от 93-го шп. до форштевня. Промежуточная палуба до и после цитадели состоял из двух полос обычной судостроительной стали: 8-мм нижнего и 12-мм верхнего, из которых оба доходили до бортовой обшивки и крепились к ней через расположенные сверху уголки. В средней части корпуса в районе 13 – 93-го шп. до поперечных броневых стенок цитадели настил промежуточной палубы состоял из одного 20-мм листа, который с помощью уголков приклёпывался к бронированию цитадели и соединялся на болтах с расположенной ниже 35-мм двухслойной броневой палубой. Над баллером руля имелся люк, в точно таком же месте, как и на броневой палубе. На “Блюхере” от ахтерштевня до 17-го и от 106-го шп. до форштевня.