В целом, ЛСД психотерапия может быть назначена в тех случаях, когда в основе заболевания лежат не органические, а психологические проблемы, которые стали результатом обучения в широком смысле этого слова. Сюда относятся и недомогания с чисто физическими проявлениями, так как в их развитии психогенные факторы играют важную роль. Такое определение показаний к психоделической терапии очень размыто и оставляет пространство для терапевтического эксперимента. Решение счесть заболевание психогенным или соматическим зависит от уровня развития медицинской науки в целом и от степени понимания каждого отдельного заболевания в частности. В силу того, что медицинское мнение, касающееся природы и генезиса различных недугов, редко оказывается единодушным, диагностика проблемы как функциональной или органической часто оказывается не объективной истиной, а лишь отражением личной философии диагноста.

Существуют условия, при которых степень единства между различными исследователями будет очень высока. Психологические факторы, очевидно, имеют больше значение при развитии различных  психоневрозов, таких как тревожность или конверсионная истерия, а также обсессивно-компульсивный невроз. Подобным образом, при расстройствах личности, алкоголизме, наркомании и различных сексуальных дисфункциях и отклонениях психогенетическая составляющая кажется бесспорной. Психосоматическое происхождение также традиционно приписывается таким заболеваниям, как бронхиальная астма, язвы желудка и двенадцатиперстной кишки, псориаз и язвенный колит. Мнение клиницистов по поводу соотношения психогенетических и соматических факторов в развитии различных депрессий, пограничных психотических состояний и так называемых эндогенных психозов, таких как шизофрения и маниакально-депрессивных психоз, очень неоднозначно. В случаях с некоторыми другими заболеваниями, такими как рак или аутоиммунные болезни, лишь отдельные исследователи считают психологические факторы релевантными.

К счастью природа ЛСД реакции, кажется, может помочь в тех случаях, когда терапевт колеблется. Одна-две пробные психоделические сессии обычно проясняют клиенту и терапевту, присутствует ли в заболевании важный психологический компонент, или нет. Эмоциональные и физические симптомы психогенетического происхождения обычно усиливаются препаратом, а содержание психоделического переживания помогает понять, каковы психодинамические, перинатальные и трансперсональные корни этой проблемы. Кроме того, во время первых психоделических опытов пациент обычно сам начинает чувствовать, можно ли повлиять на заболевание при помощи психотерапевтической работы во время ЛСД сессий. Как я уже упоминал ранее, один из замечательных аспектов действия ЛСД – это возможность выявить динамические структуры с сильным эмоциональным зарядом и сделать их содержание доступным сознанию, что позволяет проводить интроспективный анализ и проработку.

Несмотря на тот факт, что ЛСД психотерапия может оказаться полезной при очень разных эмоциональных и психосоматических заболеваниях, ее не стоит воспринимать как доступную психиатрическую панацею. Это сложная и специализированная процедура, которая требует серьезнейшей подготовки со стороны терапевта. Течение ЛСД лечения не всегда одинаково гладко и безопасно, а его результаты не всегда предсказуемы и успешны. Некоторые пациенты требуют большого количества ЛСД сессий, а сам процесс лечения оказывается медленным и болезненным. По не совсем понятным причинам, кажется, существует небольшой процент серьезно больных пациентов, которые с трудом поддаются терапии, несмотря на большое количество сессий и большие вложения времени и сил. У некоторых других процесс не заканчивается тогда, когда препарат перестает действовать, и тогда интервалы между сессиями оказываются для них сложными или даже потенциально опасными.

Клинические состояния, при которых ЛСД терапия была успешной, разделяются на четыре основные категории: 1) депрессии, неврозы и психосоматические симптомы; 2) алкоголизм, наркомания, расстройства личности и сексуальные отклонения; 3) пограничные состояния и эндогенные психозы; 4) эмоциональные и физические страдания смертельно больных, как правило, раковых пациентов.

Как правило, чем легче клиническая проблема, тем быстрее и значительнее будут результаты лечения, и тем безопаснее будет сама лечебная процедура. Лучшими кандидатами для ЛСД психотерапии кажутся субъекты, которые имеют высокий интеллект и адекватную межличностную и профессиональную адаптацию, но которым недостает жажды жизни и чувства осмысленности бытия. Хотя они могут казаться вполне успешными с точки зрения стандартов общества, они не могут установить эмоциональную связь со своими достижениями и порадоваться им. Эти симптомы относятся к категории, которую Виктор Франкл называет ноогенической депрессией. Единичная психоделическая  сессия с высокой дозой ЛСД часто оказывается достаточной для резкого изменения этой ситуации. Селективное внимание к негативным аспектам мира и пессимистическая в своей основе философия, связанные с этим состоянием, могут исчезнуть в течении нескольких часов. Такие почти депрессивные индивиды обычно выходят с успешно интегрированной сессии с приподнятым настроением, радостным отношением к существованию, повышенной самооценкой и самоприятием и большей способностью к поддержанию значимых человеческих отношений. Их внутренняя жизнь обогащается, они становятся более открытыми, начинают больше ценить красоту природы и искусства. Кроме того, многие из них  смогли творчески использовать те инсайты, которые они получили на психоделической сессии, своей профессиональной жизни.

Различные формы депрессии, кажется, необыкновенно хорошо реагируют на ЛСД психотерапию. В целом, депрессия представляет собой наиболее изменчивый психиатрический симптом, который может значительно колебаться даже без специального лечения. В результате психоделической сессии могут произойти два типа изменений депрессии, и различать их очень важно. Единичная ЛСД сессия, хорошо разрешившаяся и интегрированная, может рассеять клиническую депрессию, иногда даже глубокую, до этого продолжавшуюся месяцами. Однако это не означает, что депрессия в этом случае вылечена, и что она никогда больше не вернется; пациент может столкнуться с рецидивом, подвергшись воздействию  различных психологических и физиологических факторов.

Это можно хорошо проиллюстрировать влиянием ЛСД на так называемую периодическую депрессию. Пациент, имеющий эту форму расстройства, страдает от регулярных приступов депрессии, которые развиваются по стандартной схеме, например,  симптомы появляются в определенное время года и сохраняются определенное время. Единичное назначение ЛСД  часто может прекратить глубокую периодическую депрессию, которая в противном случае должна была бы продолжаться еще несколько месяцев или недель. Однако это не обязательно изменит общее течение болезни, и следующий приступ депрессии может появиться в обычное для него время и продолжаться столько, сколько всегда. Систематическая работа в течении серии ЛСД сессий обязательно изменит сложную динамическую структуру, лежащую в основе этой проблемы, и, таким образом, повлияет на общую схему течения болезни.

Большинство невротических расстройств обычно хорошо реагируют на ЛСД психотерапию; однако несмотря на мощный катализирующий эффект препарата, не следует ждать каких-то терапевтических чудес и мгновенных исцелений. Различные психоневрозы требуют длительных серий ЛСД сессии. В целом, большинство авторов, кажется, сходятся во мнении о том, что самые лучшие прогнозы можно делать в случаях, когда важными компонентами расстройства являются тревога и депрессия. Психиатрические пациенты, которые страдают от необоснованной тревоги или тревожных неврозов, равно как и те, чья тревога имеет форму различных фобий, хорошо реагируют на психоделическое лечение. Конверсивная истерия обычно представляет собой большие сложности, но ЛСД терапия часто оказывается успешной в этом случае. Как и при традиционном психоанализе, тревога и конверсивная истерия могут быть связанными с проблемами переноса и контрпереноса. Лечить моносимптоматические неврозы не всегда оказывается легче, чем те, которые характеризуются богатой, разнообразной и сложной клинической картиной. Часто единственный вялый симптом оказывается результатом накопленных проблем из разных областей и уровней, для разрешения которых может понадобиться очень много ЛСД сессий.