В этот период командиром всех усташских соединений был пуковник Томислав Сертич[39].

К концу 1941 г. численность Усташской войницы составляла около 15 тыс. человек, однако к концу 1942 г. усташские боевые формирования имели уже около 25 тыс. человек, составляя довольно крупную силу, которая стала требовать реорганизации. Она началась 1 июня 1943 г., когда объединением всех оперативных батальонов и других частей по территориальному признаку были созданы бригады различного назначения. Численность личного состава каждой из этих бригад колебалась от 3 до 3,5 тыс. человек[40]:

бригада охраны поглавника (Poglavnikov Tjelesni Sdrug) — 1-2-й оперативные полки, кавалерийский, подвижный, артиллериский, охранный, инженерный и два запасных батальона

1-я оперативная бригада (район Сараево, Соколац, Устипрач) — 2, 3, 14, 21, 28-й оперативные батальоны

2-я оперативная бригада (в Среме и районе Тузлы) — 4, 6, 8, 15, 18, 36-й оперативные батальоны, 1-й батальон железнодорожной охраны, 2-й горный батальон

3-я оперативная бригада (район Карловац, Огулин, Оточац и Госпич) — 5, 10, 30, 33, 35, 37-й оперативные батальоны

4-я оперативная бригада (район Глина и Бихач) — 9, 17, 19, 31, 34-й оперативные батальоны, 4-й горный батальон

5-я оперативная бригада (район Травник, Бугойно, Гламоч); 6-я (Имонски, Вргорац, Макарска) — 1, 7, 20, 24-й оперативные батальоны, инженерная рота, 1-й горный батальон

1-я (Загреб) и 2-я (Сараево) бригады железнодорожной охраны обеспечивали безопасность путей сообщения (по четыре батальона в каждой)

1-я и 2-я охранные бригады в Ясеноваце и Нова-Градишке охраняли концентрационные лагеря

В этот период пуковник Сертич по-прежнему оставался командующим всеми усташскими частями[41].

Осенью 1943 г. Усташская войница численно выросла до 32 тыс. человек. Пропорционально численности выросли и обязанности усташей по сравнению с Домобраном, поэтому потребовалась новая реорганизация, которая началась 1 января 1944 г. Ее основной смысл заключался в формировании новых оперативных бригад — с 7-й по 18-ю — за счет новых оперативных батальонов. Состав 1-7-й бригад, которые были передислоцированы в район Дрниш, Бенковац, также был несколько изменен:

бригада охраны поглавника — 1-2-й оперативные полки, кавалерийский, подвижный, бронетанковый, артиллерийский, охранный, инженерный и два запасных батальона (в октябре 1944 г. командиром бригады стал полковник Векослав Серватци)

1-я оперативная бригада — 2, 24, 29-й оперативные батальоны

2-я оперативная бригада — 6, 15, 18-й оперативные и запасной батальон

3-я оперативная бригада — 5, 10, 13, 30, 33-й оперативные и запасной батальон

4-я оперативная бригада — 9, 19, 20, 31, 34-й оперативные и охранный батальон «Оточац»

5-я оперативная бригада — 1, 7, 20, 35-й оперативные батальоны

6-я оперативная бригада — 1, 2, 3, 4, 26-й оперативные батальоны[42]

7-я оперативная бригада — 1, 2, 3, 4, 5 и 6-й оперативные батальоны

8-я оперативная бригада (район Петриня, Дубица) — 1, 2, 3, 4, 6, 8, 11-й оперативные батальоны

9-я оперативная бригада (район Острожац, Мостар, Гибела) — 1, 2, 3, 4, 5-й оперативные батальоны

10-я оперативная бригада (район Баня-Лука, Турополье) — 1, 2, 3, 4, 5, 6-й оперативные батальоны

11-я оперативная бригада (район Добой, Сараево) — 1, 3, 4, 6-й оперативные батальоны

12-я оперативная бригада (район Тузла) — 14, 23, 25, 29-й оперативные батальоны

13-я оперативная бригада (район Винковци, Илок) — 6, 16-й оперативные батальоны

14-я оперативная бригада (район Нова-Градишка) — 1-й батальон железнодорожной охраны, батальон железнодорожной охраны «Мославац», запасной батальон

15-я оперативная бригада (район Забок, Крапина) — 5, 6, 7-й оперативные батальоны

16-я оперативная бригада (район Босански-Брод, Дервента) — гарнизонные батальоны «Бродна-Саве» и «Дервента», 2-й батальон железнодорожной охраны

17-я оперативная бригада (район Карловац, Огулин) — гарнизонные батальоны «Огулин», «Врбовско», «Сушак», «Риечица», «Озалья» и «Карловац»

18-я оперативная бригада (район Оточац) — гарнизонные бригады «Оточац», «Бринье», «Сенья» и «Ловинац»

гарнизонная бригада «Загреб» (1-4-й гарнизонные батальоны)

охранная бригада (1-4-й охранные, подвижный и артиллерийский батальоны).

Помимо этого были созданы усташские гарнизонные комендатуры в Загребе и Сараево (около 1300 чел.) и 27 учебных батальонов (около 10500 чел.)[43].

Общая численность Усташской войницы в этот период составляла около 45 тыс. человек. Ее новым начальником штаба стал пуковник Иван Геренчич[44].

Надо сказать, что помимо регулярных усташских подразделений, организованных по единому плану, многие усташи, вернувшиеся из эмиграции, и руководители местных организаций создавали вооруженные группы, получившие название «диких усташей» или «усташской милиции» (Ustaska Milicija).

Число этих групп, создание которых началось в мае и июне 1941 г., непрерывно возрастало, особенно в Лике, Боснии и Герцеговине. Эта «войница» вела себя особенно разнузданно: «дикие усташи» врывались в сербские села, грабили и убивали крестьян. В своих зверствах, проводимых под предлогом «защиты хорватов и мусульман от четников», они не знали предела. Даже сам Павелич был вынужден 9 августа 1941 г. издать специальный приказ о роспуске «диких усташей», которые к тому времени, по данным министерства Домобрана, насчитывали 25–30 тыс. человек. Отряды «диких усташей» были распущены еще и потому, что немецкое командование считало их главной причиной вооруженного восстания в сербских областях. К концу 1941 г. большая часть «диких усташей» влилась в формирования Усташской войницы и различные охранные подразделения, а остальные были разоружены. Тем не менее, в некоторых районах «усташская милиция» просуществовала до конца войны[45].

После реорганизации структура Усташской войницы сохранялась без изменений недолго: до 20 ноября 1944 г., когда путем последних преобразований бригады усташей и Домобрана были слиты в единые Хорватские вооруженные силы.

В результате всех реорганизаций боевой порядок Хорватских вооруженных сил выглядела следующим образом:

1-й корпус — Корпус охраны поглавника (Poglavnikov Tjelesni Sbor):

Дивизия охраны поглавника (Poglavnikova Tjelesna Divisija) — 1-2-й охранные полки; запасной полк; артиллерийский, кавалерийский, мобильный, инженерный и другие батальоны

1-я ударная дивизия (1ša Udarna divisija) (20-22-й пехотные полки; 20-21-й артиллерийские батальоны; мобильный батальон) — лучшее соединение хорватских вооруженных сил (располагалось в районе Беловар, Загреб)

5-я дивизия (5-я усташская бригада; 11-я пехотная бригада; две артиллерийские батареи; 5-й пехотный ударный полк; мобильная бригада) — Копривница, Беловар

2-й корпус:

2-я дивизия (15 и 20-я усташские бригады; 20-я пехотная бригада; 3-я инженерная запасная бригада) — Загреб, Велика Горица

12-я дивизия (3-я горная бригада; 12-я усташская бригада; 2-й инженерный запасной батальон; три артиллерийские батареи) — Брчко

14-я дивизия (14-я усташская бригада; 19-я пехотная бригада) — Славонски-Брод, Новока

17-я дивизия (находилась в стадии формирования)

18-я ударная дивизия (как и предыдущая дивизия, находилась в стадии формирования)

3-й корпус:

3-я дивизия (1-я егерская бригада; 2 и 13-я усташские бригады; 7 и 18-й артиллерийские батальоны) — Винковцы, Чаджявица