Помимо различия в строении центры высших сигнальных подсистем имеют и несколько иной характер функционирования. Так, если центры I-й и II-й сигнальных подсистем, действуя по схеме: "раздражение анализ реакция (решение) действие" и обладая практически готовым набором решений, затрачивают на выполнение этого психического алгоритма, как правило, секунды, то в центрах III-ей, а особенно IV-й сигнальных подсистем на каждую фазу уходят часы и дни, а иногда месяцы и годы. Более того, многие раздражения I-й и II-й сигнальных подсистем стали попадать и обрабатываться в центрах III-ей, а иногда даже и IV-й сигнальных подсистем. Вот почему в характере функционирования специализированных центров высших сигнальных подсистем все больше преобладают процессы многосторонней обработки информации путем ее анализа, сравнения, оценки возможных решений, а также выработки новых понятий, ассоциаций и алгоритмов действия. Таким образом, добавившаяся в схему функционирования центров фаза "ассоциирования, творения" понятия или решения оказалась самой энергоемкой и продолжительной. По этой причине и характер функционирования этих центров становится все более ассоциативным, в связи с чем их с уверенностью можно называть ассоциативными фн. центрами высших сигнальных подсистем.
В соответствии с имеющейся локализацией различных центров нервно-психических функций на определенных участках коры, ее площадь разделилась на области, в которых объединены центры, обеспечивающие нормальное функционирование как низших, так и высших сигнальных подсистем головного мозга. Так, помимо относительно небольшой воспринимающей поверхности I-ой сигнальной подсистемы, реагирующей на самые утилитарные раздражения, и более значительной зрительнослуховой области II-ой сигнальной подсистемы, в процессе эволюции человека в коре получают все большее развитие и ассоциативные области высших сигнальных подсистем, пронизывающие все более всю фн. глубину коры головного мозга. Вследствие этого значительная часть коры начинает служить основой для их интеллектуально-творческих ассоциаций. Поэтому, если у высших обезьян свободна от непосредственного восприятия 1/3 поверхности всей коры, то у отдельных людей эта зона достигает, а иногда и превышает 2/3.
Локализация психических функций все более и более четко проявляется по мере развития структуры мозга. В настоящее время известны более 100 функционально различных центров главным образом I-й и II-й сигнальных подсистем, управляющих и контролирующих протекание тех или иных алгоритмов подсистем как внутри организма, так и вне его. Вполне естественно, что этих центров гораздо больше ввиду того, что, как мы уже установили, каждый центр "обслуживает" только свою, строго специфическую функцию внутри или вне организма, а только внешних функций, как известно, многие и многие сотни, поскольку вся социально-производственная деятельность, происходящая вокруг нас, состоит из тех или иных функций. Но у разных людей имеется свой индивидуальный набор мозговых центров, отражающийся в чертах характера каждого человека, его индивидуальной духовности и в профессиональных способностях, другими словами, формирующих то, что принято считать "душой" человека. В этой связи люди различаются не только внешним обликом своего лица, но и внутренним обликом своей нервно-психической способности к различной функциональной деятельности, являясь как бы носителями сложившихся у них спектров фн. центров головного мозга. Так, в спектрах одних людей имеются соответствующие центры, позволяющие им играть на музыкальных инструментах и даже сочинять музыку, у других таких центров нет. Одни люди способны к иностранным языкам, другие нет, одни умеют плавать, другие - нет, одни умеют ездить на велосипеде, другие - нет, одни умеют играть в шахматы, другие - нет, одни умеют составлять программы для компьютеров, другие - нет, одни умеют строить дома, другие нет, и т.д. и т.п.
По мере развития Материи и ее движения в качестве-времени происходит дальнейшая дифференциация, специализация и локализация функций в коре головного мозга человека, однако одновременная их интеграция исключает изолированное функционирование отдельных областей коры. Вследствие этого кора больших полушарий объединяет деятельность отдельных центров каждого индивидуального человека в единое целое. В соответствии с требованиями организации Материи в ассоциативных областях в глубине коры образуется все больше новых фн. центров, тем самым материализуя движение в качестве-времени на современном этапе. Их формирование происходит из бесчисленного множества возможных межнейронных связей, среди которых постепенно выделяются пути, осуществляющие вначале сравнительно небольшое число коммуникаций. Временные фн. связи (ассоциации) фиксируются тем сильнее, чем чаще они повторяются. Они нарушают первоначальную разобщенность нейронов и образуют целые ансамбли, элементы которых могут находиться в различных частях коры. По мере поступления всего объема периодической информации, в коре головного мозга фиксируется опыт каждого дня, который можно отождествить с алгоритмознанием и который изо дня в день постепенно накапливается. Его фиксации, или алгоритмозаписи, способствует хорошо налаженный механизм памяти, особенно долговременной.
Как известно, в основе этого механизма лежат биохимические реакции, меняющие структуру РНК, что отражается на биоэлектрической проводимости клеткой тех или иных импульсов, их генерации и затухании. С механизмом памяти связано наше "Я", то есть самосознание. Хранение и вспоминание информации является одной из важнейших функций коры головного мозга. У человека различают оперативную, кратковременную и долговременную памяти. Оперативная память, основанная большей частью на биофизических явлениях, может хранить небольшое количество информации в течение нескольких минут. Хранение информации в подсистеме кратковременной памяти осуществлятся со временем полураспада биохимической записи в среднем около 12 часов, то есть спустя этот отрезок времени человек способен воспроизвести лишь половину полученной им информации. И только долговременная память способна хранить биоследы полученной ранее информации на протяжении нескольких десятков лет, однако уровень воспроизведения этой информации довольно низок и в среднем не превышает 5%. Вот почему с определенного исторического момента с появлением гиперорганизмов с высокой степенью организации и наличием высокосложных алгоритмов само системное развитие вынудило человека все чаще использовать способ хранения алгоритмозаписи и другой информации в письменной форме, которая к тому же удобна еще и тем, что ею могут воспользоваться одновременно или попеременно несколько фщ. единиц - людей. Дальнейшее развитие организации гиперорганизмов потребовало еще более вместительных хранилищ информации, более ускоренный способ ее записи и воспроизведения, а также более удобный доступ к ней. Поэтому привлечение к обработке информации запоминающей способности электронно-вычислительных машин с их колоссальными возможностями еще более увеличило алгоритмофонд гиперорганизмов и коэффициент его фн. использования.
Локализация фн. центров в коре головного мозга не является случайной точно так же, как она не остается и бесследной. Структурная специализация фн. способностей подсистем коры записывается генетически и передается по наследству от поколения к поколению, при этом нервные клетки, формирующие тот или иной центр, сохраняют способность именно к данному виду функционирования. Вследствие этого в коре имеются места, которые "от рождения" предопределены для аналитической и синтетитической обработки информации, поступающей извне. Это - проекционные центры возбудимости. Их фн. предопределенность зависит от места вхождения в кору проекционных волокон нижележащих отделов нервной системы. Вокруг этих центров располагаются области, где фиксируются результаты ассоциаций преимущественно за счет элементов данного центра; несколько дальше располагаются области коры, в которых закрепляются результаты ассоциаций между центрами различной фн. значимости.