Если еще раз вернуться к указу от 27 октября 50 года до н.э. то в свете событий, происходивших вокруг трона, можно заключить, что запрет на вывоз зерна в Нижний и Верхний Египет мог объясняться не только экономическими причинами. Кажется убедительным предположение, что произошел раскол власти между сторонниками Клеопатры и ее брата, причем Клеопатра вынуждена была покинуть Александрию. В таком случае царский указ должен был не только предотвратить голод, но и обезопасить столицу от возможной осады со стороны Клеопатры, лишив ее источников снабжения.
Однако грозные события в самом Риме затмили эти местные невзгоды. С 50 года до н.э. там начинается гражданская война между оставшимися триумвирами – Помпеем, который тогда еще господствовал в самом Риме, и Цезарем, который умножил свои богатства и увеличил свое могущество благодаря завоеванию Галлии. Война началась в 49 году до н.э. Хотя большая часть высших лиц государства поддержали Помпея, уже в первые месяцы этой войны Цезарь изгнал соперника и его сторонников из Италии, и они отправились на Балканы, чтобы оттуда продолжать борьбу.
Помпею пришлось искать ресурсы для продолжения гражданской войны в восточных странах, в том числе в Египте, который зарекомендовал себя как друг и союзник Рима. Помпей же в то время считался еще его законным представителем. Помпей покинул Италию 17 марта, а через тринадцать дней его сын, Гней Помпей-младший, был отправлен в Египет за подкреплениями. В Египте тогда совместными правителями считались Клеопатра и Птолемей XIII, и, очевидно, при последнем существовал регентский совет. Гостя из Рима приняли очень хорошо, помня о том, что он был гарантом власти Птолемеев (хотя и не без выгоды для себя). Гней Помпей получил 60 кораблей и 500 солдат-габинианцев, которые на этот раз согласились покинуть Египет. Более того, на базу Помпея в Диррахии (современная Албания) были отправлены запасы зерна. Осенью того же года римский сенат (или, по крайней мере, большая его часть), собравшись в Фессалонике, принял резолюцию, в которой выражалась благодарность Египту за поддержку Помпея. В свою очередь, в благодарность за это Помпей был объявлен опекуном малолетнего Птолемея XII (подобный прецедент уже был более ста лет назад). Отсутствие упоминания о Клеопатре в этом постановлении сената еще не говорит о том, что она не считалась в это время царицей. Просто ей, как совершеннолетней, опекун был не нужен. Но возможно, отсутствие ее имени в постановлении сената связано и с тем, что в этот период Клеопатра была низложена. Сложившаяся ситуация отразилась и в папирусах, где в это время упоминается только один египетский царь, Птолемей XII, без соправительницы; с июля 49 года до н.э. исчезает на Бремя и двойная датировка по царствованию Клеопатры и Птолемея – речь идет только о последнем.
Один византийский писатель, Малалас, предположил в связи с этим, что Клеопатра тогда нашла убежище в Верхнем Египте (см. Хроника). Эту возможность нельзя исключить. В царском указе, о котором говорилось выше, этот регион был упомянут в числе тех регионов, куда запрещался ввоз хлеба. К тому же с Верхним Египтом Клеопатра была связана более тесно, чем с другими египетскими территориями.
Об этом периоде в жизни царицы упоминает Цезарь. Повествуя о событиях следующего, 48 года до н.э. он сообщает, что «за несколько месяцев до того Птолемей изгнал ее из царства». Это сообщение относится к сентябрю указанного года, а в октябре, по его словам, Клеопатры уже не было в Верхнем Египте, и она находилась на дальней восточной границе страны (см, также: Аппиан. Гражданские войны). Если подобная реконструкция событий верна, то можно было бы заключить, что Клеопатра бежала в Верхний Египет в 50 году до н.э. а в 48 году до н.э. решила вовсе покинуть страну. И прежде царицы Египта попадали в подобные ситуации. Например, дед Клеопатры изгнал из страны царицу Клеопатру в 113 году до н.э. Он, впрочем, создал и другой прецедент: дал возможность Птолемеям пользоваться поддержкой богатого и сильного города. Это был палестинский город Аскалон, который дед Клеопатры в 103 году до н.э. защитил от иудейских царей. И хотя город этот оставался независимым, там стали чеканить монеты с изображением этого египетского царя. Теперь, в 49 – 48 годах до н.э. на аскалонских монетах появляется изображение Клеопатры. Этот город был явно на стороне Клеопатры, что вполне могло обеспечить ей необходимую базу для восстановления власти, очевидно наряду с поддержкой соседнего аравийского Набатейского царства.
Войско Птолемея XIII было в это время сосредоточено на египетской восточной границе, примерно в тридцати милях от Пелусия. Основу его составляли габинианцы, оставшиеся в Египте после отсылки части их товарищей в распоряжение Помпея. Они не простили Клеопатре выдачи убийц сыновей Бибула. Но у царицы было также много влиятельных врагов среди греко-египетской знати в Александрии. Для этого было по крайней мере две причины. Во-первых, Клеопатра, как и ее отец, проводила ненавистную этой знати проримскую политику. Во-вторых, Клеопатра, в отличие от своего единокровного брата, была совершеннолетней и имела собственную волю. Птолемей не мог бы помешать знати и регентскому совету делать все, что они найдут нужным. Клеопатра же вполне могла вообще обходиться без регентского совета, а воли и решительности ей уже тогда было не занимать. Поэтому военные и политики сплотились против Клеопатры, вокруг ее несовершеннолетнего единокровного брата, за которого, по словам Цезаря, «действовали его родные и друзья».
В эпоху Птолемеев царский двор был пышным и великолепным. Многочисленные придворные и сановники отличались друг от друга по цвету одежд и особым знакам различия. На вершине этой иерархии стояли «родственники» царей, включая их «почетных родственников», которых цари именовали «братьями» или даже «отцами». За ними следовали «первые друзья» и далее – просто «друзья». Все эти категории и подразумевал Цезарь, когда говорил о «родных и друзьях» малолетнего Птолемея. Почти все «родственники», «первые друзья» и «друзья» были греческого или македонского происхождения. Египтян, не считая жрецов, при дворе было немного, и они также обычно одевались в греческом стиле.
Среди «родственников» самыми важными были царские министры. Глава правительства именовался «управляющим», так как подразумевалось, что вся страна – как бы огромное царское имение. Он управлял делами этого «имения» через своих министров, сам же находился под контролем царя.
Начиная со II века до н.э. возникла в Египте традиция назначать евнухов на министерские должности. С глубокой древности в восточных монархиях евнухи не только были ответственными за гаремы, но и играли роль царских дворецких. Их конфиденциальное положение приводило к тому, что они могли в ряде случаев получать большую власть и влияние. Птолемеи также сочли возможным во многих случаях полагаться на евнухов. От них не могли родиться незаконные дети, возможные претенденты на престол, а неприязнь и насмешки, которым их подвергали окружающие, могли бы воспрепятствовать их попыткам захватить власть для себя. Поэтому Птолемеи, как и другие эллинистические государи, бывало, назначали евнухов не только военачальниками (первый такой случай – некий Аристоник, выдвинутый на такую должность в 186 г, до н.э.), но даже и первыми министрами. Как правило, они были по происхождению греками, но иногда на этот пост ставили и эллинизированных азиатов. Обычно (если это не были особо влиятельные лица) первые министры правили в течение года, подобно римским консулам, хотя на должность главы правительства могли повторно назначить то же лицо. К сожалению, нам неизвестны имена всех, кто занимал должность первого министра в правление Клеопатры. В 52 – 51 годах до н.э. в самом начале ее правления, главой правительства был некий Гефестион. (Возможно, он же возглавлял правительство в 54 г, до н.э. во времена господства римского финансиста Постума.) Следующим первым министром, возглавлявшим правительство в период кризиса, связанного с убийством сыновей Бибула, был Протарх. В 49 – 48 годах до н.э. когда Клеопатра, вероятно, была низложена, правительство возглавлял какой-то Птолемей (может быть, вовсе не представитель династии).