В 60-е — начале 70-х гг. особое внимание уделялось комплексным исследованиям, связанным с хлопководством, орошением, энергетикой, цветной металлургией и др. Были разработаны комплексные гидроэнергетические системы с автоматическим и телемеханическим управлением, новые конструкции плотин, системы горизонтального и вертикального дренажа, более совершенная технология возделывания хлопчатника, позволившие ввести в с.-х. оборот значительные площади Голодной, Дальверзинской, Шерабадской, Каршинской степей, Ферганы и т.д. (А. Н. Аскоченский, В. В. Пославский, Р. А. Алимов, Б. Д. Коржавин, С. Т. Алтунин и др.). Успешное решение комплекса проблем освоения целинных земель узбекской и таджикской частей Голодной степи отмечено в 1972 Ленинской премией. Подготовка научных кадров, особенно национальных, по многим областям науки, постоянно проводившаяся с помощью АН СССР, дала возможность расширить направления научных исследований и создать ряд новых научных учреждений.

  Математика. Основные центры — институт математики АН Узбекской ССР, Ташкентский университет им. В. И. Ленина, Самаркандский университет им. Навои. Продолжались исследования по теории вероятностей, математической статистике (цикл работ Т. А. Сарымсакова и С. Х. Сираждинова по предельным теоремам теории вероятностей и её применениям). В области функционального анализа развивалась теория топологических полуполей (Т. А. Сарымсаков). В области дифференциальных и интегральных уравнений работали М. С. Салахитдинов, И. С. Аржаных, И. С. Куклес, А. Н. Филатов. Продолжалось изучение истории развития математики на Ближнем и Среднем Востоке в средние века (Т. Н. Кары-Ниязов).

  Физика. В институте ядерной физики АН Узбекской ССР и в Ташкентском университете развивались исследования по ядерной физике и физике частиц высоких энергий (С. В. Стародубцев, С. А. Азимов), радиоактивационному анализу (Е. М. Лобанов, У. Г. Гулямов). В институте электроники АН Узбекской ССР (основан в 1967), Ташкентском университете и Политехническом институте, Бухарском педагогическом институте осуществлялись исследования в области физической электроники (У. А. Арифов), диэлектрической электроники, опто- и микроэлектроники (Э. И. Адирович); в Самаркандском университете и Ташкентском педагогическом институте им. Низами — молекулярной физики, спектроскопии жидкостей и растворов (А. К. Атаходжаев) и т.д. Теоретически обоснованы и созданы многие гелиотехнические установки по опреснению и нагреванию воды и др. (Г. Я. Умаров).

  Астрономия. В Астрономическом институте АН Узбекской ССР (создан в 1966 на базе Ташкентской астрономической обсерватории) изучались переменные звёзды, определялись прямые восхождения звёзд, продолжались наблюдения по программам Всесоюзной службы Солнца и времени (В. П. Щеглов). Филиал института — Международная широтная станция им. Улугбека в Китабе изучала изменяемость географических широт земных полюсов; с 1974 станция (совместно с Главной астрономической обсерваторией АН СССР) начала многолетние наблюдения, связанные с изучением дрейфа континентов.

  Механика и процессы у правления. В институте кибернетики с Вычислительным центром АН Узбекской ССР (основан в 1966) велись исследования по экономической и технической кибернетике, теории информации и вычислительной технике. Разработаны общие алгоритмические методы исследования больших систем, методологические основы создания республиканской автоматизированной системы управления (В. К. Кабулов и др.), изучаются проблемы передачи данных по высокочастотным каналам линий электропередачи и т.д. В области энергетики и автоматики велись работы по теории и методам расчёта режимов больших электрических систем (Х. Ф. Фазылов), по кадастру и режиму возобновляющихся источников энергии, автоматизации электропривода (М. З. Хамудханов), автоматизации и телемеханизации управления объектами оросительных систем и т.д. Институт механики и сейсмостойкости сооружений и Ташкентский зональный научно-исследовательский и проектный институт типового и экспериментального проектирования гражданстроя (основан в 1964) занимались проблемами сейсмостойкого строительства (в том числе подземных сооружений), механики грунтов и теории упругости (М. Т. Уразбаев). Создана теория движения многофазных сред в трубопроводах (Х. А. Рахматулин, Д. Ф. Файзуллаев), использовавшаяся при проектировании трубопроводов и регулировании речных русел. Развивалась теория хлопкоуборочных машин (Х. Х. Усманходжаев).

  Геология, геофизика, география. Геологическими институтами проводились планомерные минералого-геохимические исследования почти всех рудных месторождений. Разработана геохимическая классификация минералов (А. С. Уклонский). Развивалось учение о геологических формациях (В. И. Попов). Продолжались металлогенические и петрологические исследования, составление металлогенических и прогнозных карт, изучение связи оруденения с магматизмом (Х. М. Абдуллаев, И. Х. Хамрабаев). Институт гидрогеологии и инженерной геологии министерства геологии Узбекской ССР (основан в 1960) продолжал крупномасштабные исследования по гидрогеологии, мелиоративной гидрогеологии, лёссоведению и геодинамическим процессам (Г. А. Мавлянов, Н. А. Кенесарин). В 1971 создано Научно-производственное гидрогеологическое Объединение министерства геологии Узбекской ССР. В институте геологии и разведки нефтяных и газовых месторождений разработаны научные основы поиска нефти и газа (А. М. Акрамходжаев, А. Г. Бабаев), обеспечившие открытие крупнейших месторождений газа на территории У. В 1966 основан институт сейсмологии АН Узбекской ССР, в состав которого вошли филиал в Андижане, 11 сейсмических станций и ионосферная станция. Проводились исследования по гравиметрии, электроразведке, сейсмологии (сейсморайонирование всей территории У., крупных городов, промышленных центров и гидротехнических сооружений; выявление предвестников землетрясений). На территории У. изучались земная кора и верхняя мантия. Разработана методика краткосрочного прогноза струйных течений в нижней стратосфере над югом СССР, велись исследования по статистическим методам прогноза погоды, изучались проблемы активного воздействия на метеорологические процессы (противоградовые работы и др.). Завершено природное районирование Туранской физико-географической провинции на ландшафтной основе. Осуществлена с.-х. оценка природных условий У., Таджикистана и Туркменистана в связи с проблемой переброски вод Сибири в бассейн Аральского моря. Проведено геоботаническое, почвенно-климатическое, пастбищно-климатическое районирование У., а также агроклиматическое районирование республик Средней Азии. Изучались реки и озёра Средней Азии (Ташкентский университет, Отдел географии АН Узбекской ССР); систематически проводятся гляциологические исследования.

  Химия и химическая технология. Институтом химии растительных веществ и Отделом биоорганической химии АН Узбекской ССР (основана в1973) проводились исследования по химии растительных веществ, главным образом алкалоидов (А. С. Садыков, С. Ю. Юнусов). Получены высокоэффективные твёрдые и жидкие комплексные удобрения и разработана технология их производства (М. Н. Набиев), дефолианты, гербициды, средства борьбы с вредителями. Велись работы по созданию и применению поверхностно-активных веществ в структурообразовании почв, геологоразведочном бурении (К. С. Ахмедов), по химии хлопковой целлюлозы (Х. У. Усманов). Разрабатывались вопросы производства высококачественных цементов (И. С. Канцепольский). В НИИ по нефтепереработке министерства нефтехимической и нефтеперерабатывающей промышленности СССР (основан в 1964) исследовалась теория синтеза алюмосиликатного катализатора для крекинга нефтяных дистиллятов (А. С. Султанов).

  Биологические и с.-х. науки развивались в НИИ АН Узбекской ССР, университетах и ряде педагогических институтов. Институтом ботаники АН Узбекской ССР в 1941—62 издана «Флора Узбекистана» в 6 томах, в 1973 — «Карта растительности Узбекистана». Подготавливается 10-томный «Определитель растений Средней Азии» (т. 1—4, 1968—74). Разработана экологическая классификация растительности Средней Азии. Обоснованы и нашли практическое применение методы фитомелиорации и агротехники, повышающие продуктивность пустынных, полупустынных и предгорных пастбищ (Д. К. Саидов), а также методы культурного возделывания ряда технических растений (солодки, герани и др.). Сотрудники Центрального ботанического сада АН Узбекской ССР в Ташкенте (основан в 1943 на базе ботанического сада Среднеазиатского университета) и его филиала в г. Нукусе осуществляли работы по интродукции и акклиматизации растений, отбору видов для местных условий (Ф. Н. Русанов). В институте зоологии и паразитологии АН Узбекской ССР велось комплексное изучение животного мира пустынь (Т. З. Захидов) и экологии ядовитых змей. Создан серпентарий. Исследовалась ихтиофауна водоёмов, в том числе Аральского моря (Каракалпакский филиал АН Узбекской ССР), разрабатывались рекомендации по повышению рыбопродуктивности водоёмов и воспроизводству ценных пород рыб. В 1953—1961 изданы т. 1—3 «Фауны Узбекской ССР». Продолжалось изучение паразитофауны человека и животных, разрабатывались меры борьбы с опасными заболеваниями (А. Т. Тулаганов, М. А. Султанов, Р. А. Алимджанов). Исследовались биологические и интегрированные методы борьбы с вредителями сельского хозяйства. Разработаны рекомендации по массовому культивированию хлореллы, сцендесмуса и др. водорослей как стимуляторов при кормлении с.-х. животных, в том числе птиц и шелковичных червей (А. М. Музафаров).