31 января 2012 года сайт стал недоступен для своих пользователей. Сайт был закрыт право охра ни тель ны ми органами в рамках расследования уголовного дела по статьи 176 части 2 УК Украины (нарушение авторских и смежных прав). Уголовное дело было возбуждено по инициативе официальных представителей ведущих мировых производителей программного обеспечения — международных корпораций  Adobe Systems Inc. ,  Microsoft Corporation ,  Graphisoft Inc. . По данным МВД во время обысков в офисе и дата-центрах EX.UA было изъято большое количество компьютерной техники и сетевого оборудования, в том числе 200 серверов с общим объёмом контента свыше 6000 терабайт (администрация сервиса данную информацию опровергала и сообщала только о при оста нов ле нии делегирования доменного имени регистратором imena.ua)^[4], делегирование доменного имени остановлено. Оперативники выяснили, что администрацию ресурса возглавлял гражданин Латвии. Статья, по которой возбудили уголовное дело, предусматривает лишение свободы сроком до 5 лет с конфискацией экземпляров произведений и соответствующего оборудования.
1 февраля 2012 народный депутат Украины Владимир Даниленко обратился в Генеральную прокуратуру Украины с требованием проверить законность возбуждения уголовного дела против интернет-ресурса EX.ua^[5].
2 февраля после акций протеста и DDoS-атак на прави тель ст вен ные сайты (пострадали сайты Президента [1], Кабинета министров [2], МВД [3], Службы безопасности Украины [4], Верховной рады [5]) милиция согласилась вернуть сервису блокированное доменное имя. Сайт стал доступен 3 февраля. Уголовное дело, возбуждённое против администрации сайта, закрыто не было, но сайт снова появился в сети — впрочем, подавляющая часть данных была недоступна для скачивания^[6].
29 марта народный депутат Украины, первый секретарь Сумского обкома КПУ Владимир Даниленко сообщил о привлечении следователей, виновных в закрытии EX.UA, к ответст вен нос ти^[7].
15 июня 2012 года ресурсу EX.UA были возвращены все 123 изъятых сервера. Представители ресурса заявили, что вся недоступная информация будет восстановлена в течение недели.
По имеющейся информации, арест серверов был произведён в результате дипломатического давления со стороны США^[8].