Этот вывод комиссии исследователи неоднократно подвергали критике, так как подобная траектория пули маловероятна. В связи с этим среди оппонентов официальной теории убийства Кеннеди даже возник иронический термин «magic bullet» («магическая» или «волшебная» пуля). Теория о «волшебной пуле» тесно связана с проблемой наличия второго стрелка: если допустить, что одна и та же пуля не могла ранить Кеннеди, изменить траекторию и ранить Конналли, а Освальд, как установили эксперты, не имел времени, чтобы сделать более трех выстрелов, то единственным возможным объяснением будет наличие, как минимум, еще одного стрелка, которому и принадлежал недостающий выстрел. Другой аргумент противников официальной версии состоит в том, что в теле Конналли якобы было обнаружено больше металлических частиц, чем могла оставить единственная пуля. Однако этот аргумент был опровергнут: в реальности все найденные частицы вполне могли принадлежать одной пуле. Сказать со стопроцентной уверенностью о том, как же на самом деле произошло убийство, не мог ни один эксперт. Споры по поводу «преступления века» продолжались не один год.
И сейчас, более сорока лет спустя, события тех трагических мгновений, отхронометрированные до долей секунды, все еще остаются открытыми для интерпретаций.
Ли Харви Освальд был арестован еще в день убийства, однако до суда не дожил. 24 ноября 1963 г. при переводе из полицейского управления Далласа в окружную тюрьму его застрелил некий Джейкоб Леон Рубинштейн, известный как Джек Руби, профессиональный гангстер, владелец ночного клуба в Далласе. Вот как это произошло. Следствие, предъявив Освальду официальное обвинение в убийстве президента Кеннеди, приняло решение перевезти обвиняемого в окружную тюрьму. К тому времени известие о поимке предполагаемого убийцы уже стало достоянием общественности, и здание полиции, где находился Ли Харви Освальд, осаждали толпы репортеров. Следствие разрешило журналистам снимать обвиняемого на территории подземного гаража здания — перед посадкой в специальный автомобиль. Здесь Освальда и убили. В этот момент его окружала многочисленная толпа репортеров, велась фото-, кино— и телесъемка конвоируемого, поэтому непосредственно момент убийства был заснят репортерами как на фото, так и на кинопленку и даже попал в прямой эфир телевидения. Джек Руби, до того момента находившийся в толпе, внезапно отделился от нее и двинулся в сторону Освальда, а оказавшись на расстоянии одного шага от конвоируемого, выстрелил в него из револьвера, после чего был сбит с ног полицейскими. Ли Харви Освальд получил смертельное ранение, от которого он впоследствии умер в далласской больнице.
Сразу после убийства Джек Руби был схвачен. Впоследствии он признался, что действовал один и хотел убить Освальда, чтобы отомстить за убийство президента Кеннеди и избавить супругу убитого президента от необходимости выступать свидетелем на процессе по убийству главы государства. Теперь началось расследование убийства Освальда, оно было достаточно скоротечным, и в начале 1964 года над Джеком Руби состоялся суд, который 14 марта 1964 года признал его виновным в убийстве и приговорил к смертной казни. Судебное решение было обжаловано адвокатами Руби. Итогом этого явилась отмена приговора апелляционным судом и направление дела на повторное рассмотрение. Однако в декабре 1966 года у Джека Руби, содержавшегося в окружной тюрьме Далласа, был обнаружен рак легких. 3 января 1967 года он умер. Дело против Руби было закрыто в связи со смертью обвиняемого.
Что касается Ли Харви Освальда, то он так и остался «предполагаемым» убийцей. Суд, учитывая «отсутствие» других обвиняемых, было проводить не над кем. Поэтому виновность Освальда так никогда и не была доказана или опровергнута в суде.
Убийство Освальда, произошедшее всего лишь два дня спустя после трагической гибели Кеннеди, породило многочисленные подозрения в существовании заговора против президента. Однако, согласно официальным выводам комиссии Уоррена, Ли Харви Освальд действовал в одиночку. Доклад специальной комиссии был опубликован в печати в сентябре 1964 года, явившись своеобразным «резюме» 26 томов свидетельских показаний, засекреченных до 2029 года «в связи с государственной безопасностью». Члены комиссии заслушали 552 свидетеля, получили более трех тысяч отчетов судебных и правоохранительных органов, которые, в свою очередь, провели около 26 тысяч бесед. Однако доклад, который должен был пролить свет на таинственные обстоятельства «преступления века», вызвал всеобщее разочарование. Свидетели преступления с удивлением обнаружили замалчивание, искажение или прямую фальсификацию собственных показаний, заверенных по всей форме. Кстати, некоторые из свидетелей скончались от «тех или иных причин» в течение нескольких последующих лет.
Официальный отчет комиссии Уоррена резко критиковал ЦРУ, ФБР и полицию Далласа за то, что они не смогли предотвратить гибель президента. Основываясь на докладе, в котором было множество неточностей, противоречий и ошибок, комиссия, тем не менее, дала однозначное заключение, что заговора против президента не существовало. Однако ни американская, ни мировая общественность так и не удовлетворилась официальным выводом комиссии Уоррена. Продолжали возникать все новые версии трагедии.
Джона Фицджеральда Кеннеди любили одни и ненавидели другие. Он вошел в историю как харизматичный лидер, на время правления которого выпали одни из самых тяжелых страниц мировой истории XX в. — Берлинский и Кубинский кризисы, когда две мировые сверхдержавы СССР и США — стояли на пороге ядерной войны. Во многом благодаря блестящему политическому дару Кеннеди тогда удалось сохранить мир. Естественно, людям была не безразлична история гибели такого человека. Люди хотели знать правду. Действительно ли президента убил Ли Харви Освальд? Если да, то каковы мотивы этого преступления? Действовал он в одиночку или же это был заговор? Кто такой Джек Руби? Что заставило его убить Освальда? И если существовал заговор, то кто стоял за ним — мафия, кубинцы, русские, ЦРУ?
Одна из существующих версий такова: американец Ли Харви Освальд был использован кубинской спецслужбой с подачи КГБ. Президента США убили в отместку за попытку его администрации организовать покушение на Фиделя Кастро. Якобы убийство инспирировал и оплатил сам Кастро, для которого это был отчаянный шаг самозащиты. Сторонники этой версии считают, что роль «кубинцев» в самом сенсационном убийстве XX века была известна преемнику Кеннеди Линдону Джонсону, но он предпочел замять кубинский «след», опасаясь, что в противном случае общественное мнение США заставит его вторгнуться на остров Свободы, а это чревато угрозой ядерного конфликта с СССР. Линдон Джонсон также опасался, что кубинская версия приведет к «правому бунту» в Америке, который на два поколения закроет Демократической партии путь к власти. Секретарь Линдона Джонсона Джозеф Калифано опубликовал в своих мемуарах слова Джонсона, который тот якобы сказал ему: «Кеннеди пытался прикончить Кастро, но Кастро его опередил».
Другие исследователи считают, что Освальд был использован заговорщиками «втемную», т. е. он принял участие в покушении, полагая, что убить собираются губернатора Техаса Коннали. Ли Харви Освальду якобы было поручено стрелять в Конналли, что он и сделал, а Джон Кеннеди получил смертельную пулю от другого снайпера. Эксперты уверяли, что так и не смогли с достоверностью определить — был ли убит президент пулями, выпущенными из винтовки Освальда. Но о том, что выстрелы были слышны не только со стороны склада — сзади по движению кортежа, а также спереди и сбоку, свидетельствовали многие очевидцы трагедии.
Не раз говорили и о причастности к этому громкому делу пресловутой «руки Москвы». Утверждали, что Ли Харви Освальд якобы прошел обучение в Комитете государственной безопасности СССР, который и заказал ему убийство Джона Фитцджеральда Кеннеди. Известно, что в период своего проживания в Белоруссии Ли Харви Освальд действительно находился под плотным присмотром КГБ. Однако серьезных подозрений в том, что он был профессионально связан с Комитетом госбезопасности СССР, нет. После внимательного изучения образа жизни и поведения американца, в КГБ пришли к выводу, что использовать его в качестве агента, который бы работал на советскую разведку в США, нецелесообразно. Известно, что документы, касающиеся Ли Харви Освальда, которым занималась внутренняя служба Комитета госбезопасности СССР, вскоре после убийства Джона Кеннеди были переданы Соединенным Штатам. КГБ прежде всего хотел исключить подозрения, что Освальд был связан с органами безопасности СССР. Поэтому версия о Ли Харви Освальде как о некоей фигуре, использовавшейся Комитетом государственной безопасности СССР, имеет место, но вряд ли она правдоподобна. Советское руководство тех лет при всех его недостатках вряд ли могло принять такое самоубийственное решение. Все понимали, что убийство президента США — это объявление войны. Поэтому в СССР всеми силами велась очень серьезная, систематическая и последовательная работа на привлечение внимания мировой общественности к факту участия в убийстве Джона Кеннеди консерваторов, спецслужб, в частности, ЦРУ и ФБР, кубинских эмигрантов, которые были на содержании у ЦРУ, военно-промышленного комплекса. Эти версии активно прорабатывались и внедрялись в массовое сознание. В КГБ умело пользовались всякого рода слухами и домыслами, придавая им характер версий, которые требовали рассмотрения и будоражили общественное мнение.